More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4163 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  78.45 
 
 
428 aa  655    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  100 
 
 
428 aa  847    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  74.23 
 
 
437 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  74.23 
 
 
437 aa  630  1e-179  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  73.29 
 
 
437 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  54.98 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  55.53 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  57.94 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  53.07 
 
 
428 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  52.94 
 
 
429 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  47 
 
 
440 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  44.79 
 
 
421 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  43.63 
 
 
419 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  43.33 
 
 
423 aa  343  2e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  45.41 
 
 
423 aa  338  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  41.59 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  41.36 
 
 
441 aa  336  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  42.29 
 
 
451 aa  332  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  41.47 
 
 
431 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  42.06 
 
 
441 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  42.68 
 
 
424 aa  323  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  43.82 
 
 
440 aa  323  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  41.59 
 
 
441 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  41.59 
 
 
441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  41.12 
 
 
441 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  41.59 
 
 
441 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  41.81 
 
 
422 aa  317  3e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  41.12 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  40.89 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  41.36 
 
 
441 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  41.36 
 
 
441 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  41.36 
 
 
441 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  41.36 
 
 
441 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  41.82 
 
 
444 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  41.59 
 
 
441 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  40.57 
 
 
424 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  41.59 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  41.59 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  41.59 
 
 
441 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  41.36 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  41.36 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  40.65 
 
 
426 aa  307  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  41.12 
 
 
444 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  40.76 
 
 
427 aa  301  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  43.06 
 
 
427 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  42.68 
 
 
417 aa  295  9e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  40.52 
 
 
427 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  40.23 
 
 
427 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  37.61 
 
 
440 aa  288  2e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  40.67 
 
 
424 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  39.49 
 
 
425 aa  280  4e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.05 
 
 
577 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  37.38 
 
 
425 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  44.2 
 
 
422 aa  272  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  40.14 
 
 
415 aa  270  5e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  41.67 
 
 
967 aa  259  5.0000000000000005e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  37.6 
 
 
429 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  34.12 
 
 
429 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  35.52 
 
 
421 aa  231  2e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  36.32 
 
 
447 aa  229  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  35.05 
 
 
421 aa  224  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  31.38 
 
 
421 aa  212  9e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  32.11 
 
 
429 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  32.48 
 
 
422 aa  210  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.15 
 
 
408 aa  207  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  31.22 
 
 
424 aa  202  6e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  31.31 
 
 
428 aa  168  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  34.88 
 
 
445 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  30.79 
 
 
445 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  30.42 
 
 
444 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  30.42 
 
 
444 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  31.19 
 
 
447 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  31.32 
 
 
446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  29.97 
 
 
465 aa  150  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  31.07 
 
 
447 aa  144  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.29 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.98 
 
 
419 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  24.8 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.04 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.27 
 
 
405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  29.07 
 
 
400 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.24 
 
 
408 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  28.7 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  25.25 
 
 
401 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  27.91 
 
 
414 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  26.71 
 
 
421 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  27.05 
 
 
404 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  33.43 
 
 
413 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  27.36 
 
 
426 aa  104  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  33.83 
 
 
429 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  25.47 
 
 
436 aa  104  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  33.76 
 
 
418 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  32.34 
 
 
429 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  26.67 
 
 
419 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  25.35 
 
 
424 aa  100  4e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  21.99 
 
 
429 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  25 
 
 
426 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  25.74 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  25.54 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  24.17 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>