More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12700 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  76.81 
 
 
429 aa  656    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  100 
 
 
428 aa  835    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  57.65 
 
 
431 aa  460  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  55.53 
 
 
431 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  51.65 
 
 
437 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  51.65 
 
 
437 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  52.69 
 
 
428 aa  421  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  53.07 
 
 
428 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  51.53 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  51.13 
 
 
451 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  46.59 
 
 
440 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  42.32 
 
 
419 aa  339  5e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  42.66 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  43.5 
 
 
421 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  42.66 
 
 
441 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  43.16 
 
 
451 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  43.1 
 
 
423 aa  317  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  43.12 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  43.87 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  43.33 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  43.59 
 
 
441 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  42.65 
 
 
424 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  43.33 
 
 
441 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  42.89 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  42.89 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  42.35 
 
 
423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  43.13 
 
 
431 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  43.12 
 
 
441 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  43.09 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  43.09 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  43.09 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  43.09 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  42.44 
 
 
424 aa  305  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  43.36 
 
 
444 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  42.25 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  43.36 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  42.08 
 
 
427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  43.59 
 
 
441 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  43.59 
 
 
444 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  43.59 
 
 
444 aa  301  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  41.8 
 
 
426 aa  301  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  42.86 
 
 
440 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  43.59 
 
 
444 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  43.59 
 
 
444 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  42.89 
 
 
444 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  43.06 
 
 
427 aa  290  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  39.06 
 
 
427 aa  286  7e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  42.15 
 
 
422 aa  283  5.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  42.14 
 
 
424 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  39.76 
 
 
417 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  39.62 
 
 
415 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  42.63 
 
 
422 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  39.91 
 
 
577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  39.43 
 
 
967 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  38.26 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  37.89 
 
 
425 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  34.1 
 
 
429 aa  242  1e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  37.07 
 
 
425 aa  241  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  34.54 
 
 
429 aa  233  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  35.8 
 
 
422 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  33.59 
 
 
408 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  33.26 
 
 
429 aa  203  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  30.17 
 
 
421 aa  189  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  28.44 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  29.68 
 
 
421 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  32.2 
 
 
424 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  28.47 
 
 
444 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  28.47 
 
 
444 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  32.36 
 
 
465 aa  152  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  28.54 
 
 
445 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  28.25 
 
 
428 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  29.82 
 
 
447 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  28.41 
 
 
422 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  31.94 
 
 
447 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  29.14 
 
 
408 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  30.23 
 
 
446 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  32.09 
 
 
419 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  30.67 
 
 
445 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.52 
 
 
405 aa  136  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  26.18 
 
 
409 aa  134  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.57 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.49 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  29.89 
 
 
434 aa  123  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.63 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  30.02 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  28.64 
 
 
396 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  30.05 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  28.43 
 
 
396 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  30.77 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.39 
 
 
436 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  30.73 
 
 
418 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  30.29 
 
 
413 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.81 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.83 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.04 
 
 
405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  28.23 
 
 
384 aa  111  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  25.97 
 
 
414 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  27.19 
 
 
452 aa  108  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  28.57 
 
 
404 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  25.69 
 
 
401 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>