More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0587 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  100 
 
 
437 aa  859    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  95.65 
 
 
437 aa  823    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  100 
 
 
437 aa  859    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  74.23 
 
 
428 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  69.72 
 
 
428 aa  590  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  51.7 
 
 
451 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  52.96 
 
 
431 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  56.6 
 
 
431 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  51.65 
 
 
428 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  52.83 
 
 
429 aa  424  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  47.93 
 
 
440 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  47.06 
 
 
421 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  43.85 
 
 
419 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  44.06 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  43.93 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  44.52 
 
 
423 aa  339  5e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  43.25 
 
 
431 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  45.73 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  42.79 
 
 
424 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  42.29 
 
 
441 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  44.29 
 
 
441 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  43.82 
 
 
441 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  43.82 
 
 
441 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  42.29 
 
 
440 aa  323  5e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  42.06 
 
 
441 aa  322  6e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  44.06 
 
 
441 aa  322  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  43.69 
 
 
451 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  44.39 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  44.39 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  44.39 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  44.39 
 
 
441 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  43.06 
 
 
422 aa  322  9.999999999999999e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  41.82 
 
 
441 aa  316  4e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  41.82 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  41.95 
 
 
424 aa  312  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  41.82 
 
 
444 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  42.29 
 
 
444 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  42.29 
 
 
444 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  42.29 
 
 
441 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  42.29 
 
 
444 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  42.29 
 
 
444 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  41.15 
 
 
426 aa  309  8e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  41.59 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  42.52 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  38.67 
 
 
440 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  46.47 
 
 
417 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  40.8 
 
 
427 aa  299  6e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  40.8 
 
 
427 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  40.52 
 
 
427 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  41.05 
 
 
424 aa  293  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  45.55 
 
 
422 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  39.91 
 
 
415 aa  280  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  38.75 
 
 
425 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  37.32 
 
 
425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.36 
 
 
577 aa  264  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  39.84 
 
 
429 aa  249  6e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  40.58 
 
 
447 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  38.36 
 
 
967 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  32 
 
 
429 aa  238  2e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  32.79 
 
 
422 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  33.49 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  33.74 
 
 
421 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.08 
 
 
408 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.25 
 
 
421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  30.5 
 
 
421 aa  199  6e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  31.53 
 
 
424 aa  187  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  31.68 
 
 
465 aa  158  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  28.73 
 
 
428 aa  157  3e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  30.1 
 
 
444 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  30.1 
 
 
444 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  30.77 
 
 
445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  32.9 
 
 
447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  30.12 
 
 
445 aa  146  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  29.91 
 
 
446 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.95 
 
 
419 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.89 
 
 
422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  30.81 
 
 
447 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  32.65 
 
 
434 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  25.73 
 
 
409 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.88 
 
 
405 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.78 
 
 
408 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.31 
 
 
400 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.59 
 
 
401 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.15 
 
 
405 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  31.35 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  27.23 
 
 
414 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  26.23 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  28.57 
 
 
404 aa  113  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  33.55 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  30.17 
 
 
429 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  25.23 
 
 
424 aa  110  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  31.22 
 
 
413 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.88 
 
 
436 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  25.67 
 
 
426 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.42 
 
 
414 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  27.2 
 
 
404 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  25.75 
 
 
419 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  26.05 
 
 
396 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  24.77 
 
 
405 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  23.43 
 
 
411 aa  100  5e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>