More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1020 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  100 
 
 
422 aa  810    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  55.77 
 
 
421 aa  427  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  48.69 
 
 
427 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  49.64 
 
 
427 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  48.21 
 
 
423 aa  380  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  47.75 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  47.36 
 
 
423 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  47.75 
 
 
451 aa  354  2e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  47.04 
 
 
441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  47.52 
 
 
431 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  47.52 
 
 
440 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  46.06 
 
 
427 aa  346  5e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  47.99 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  44.89 
 
 
440 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  43.28 
 
 
424 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  47.75 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  47.52 
 
 
441 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  44.15 
 
 
424 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  47.28 
 
 
441 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  43.71 
 
 
426 aa  339  5e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  47.52 
 
 
441 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  47.52 
 
 
441 aa  338  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  47.52 
 
 
441 aa  338  8e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  47.52 
 
 
441 aa  338  8e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  45.41 
 
 
427 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  45.86 
 
 
441 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  45.63 
 
 
441 aa  332  8e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  45.84 
 
 
441 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  42.07 
 
 
419 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  46.65 
 
 
417 aa  330  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  45.63 
 
 
441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  45.63 
 
 
444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  45.63 
 
 
444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  45.63 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  45.86 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  45.63 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  46.08 
 
 
444 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  41.87 
 
 
422 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  45.63 
 
 
441 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  42.43 
 
 
440 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  44.87 
 
 
424 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  43.33 
 
 
437 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  43.33 
 
 
437 aa  312  9e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  42.86 
 
 
437 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  43.4 
 
 
429 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  42.42 
 
 
425 aa  309  8e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  43.53 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  40.76 
 
 
425 aa  300  5e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  41.84 
 
 
428 aa  298  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  43.68 
 
 
415 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  39.64 
 
 
451 aa  295  7e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  43.43 
 
 
431 aa  296  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  40.61 
 
 
428 aa  290  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  42.92 
 
 
428 aa  290  4e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  38.77 
 
 
429 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  39.46 
 
 
577 aa  260  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  41.11 
 
 
967 aa  253  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  36.88 
 
 
429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  38.53 
 
 
447 aa  242  9e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  36.49 
 
 
429 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  35.58 
 
 
408 aa  237  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  37.5 
 
 
422 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.96 
 
 
421 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  33.16 
 
 
421 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  33.51 
 
 
421 aa  194  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  33.63 
 
 
444 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  33.63 
 
 
444 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  30.8 
 
 
445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  35.04 
 
 
445 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  30.7 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  32.43 
 
 
446 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  34.22 
 
 
405 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  33.57 
 
 
447 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  30.28 
 
 
408 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  31.55 
 
 
447 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  31.34 
 
 
419 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  31.79 
 
 
405 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  30.75 
 
 
465 aa  150  3e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  33.33 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  29.4 
 
 
400 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  33.77 
 
 
404 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  36.57 
 
 
418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  32.08 
 
 
396 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  27.75 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  34.17 
 
 
434 aa  134  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.27 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  25.96 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  34.03 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  26.42 
 
 
402 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  27.74 
 
 
414 aa  126  7e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  36.27 
 
 
429 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  36.03 
 
 
429 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.62 
 
 
421 aa  124  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  23.46 
 
 
436 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  35.64 
 
 
413 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  29.52 
 
 
404 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.65 
 
 
411 aa  120  6e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  28.67 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  30.55 
 
 
396 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  29.62 
 
 
452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>