More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1699 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  100 
 
 		 421 aa  825    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  52.77 
 
 		 424 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  46.89 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  46.17 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  36.17 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  34.48 
 
 		 421 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  33.16 
 
 		 426 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  31.85 
 
 		 428 aa  211  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  34.68 
 
 		 440 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  30.95 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  31.48 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  33.95 
 
 		 425 aa  202  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  30.91 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  31.38 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  30.5 
 
 		 437 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  30.5 
 
 		 437 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  33.33 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  33.59 
 
 		 417 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  31.93 
 
 		 441 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  29.88 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  30.19 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  33.56 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  31.59 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  33.65 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  31.47 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  32.94 
 
 		 427 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  31.94 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  33.18 
 
 		 440 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  30.71 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  32.87 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  32.87 
 
 		 441 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  30.98 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  31.13 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  32.73 
 
 		 429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  33.1 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  28.44 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  31.78 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  33.33 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  31.47 
 
 		 441 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.75 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  31.47 
 
 		 441 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  32.87 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  31.75 
 
 		 409 aa  182  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  29.71 
 
 		 429 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  31 
 
 		 441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  33.26 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  33.26 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  33.26 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  31 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  31 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  33.33 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  33.33 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  31 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  31 
 
 		 441 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  33.61 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  32.63 
 
 		 444 aa  176  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  32.68 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  31.07 
 
 		 424 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  31.27 
 
 		 423 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  31.19 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  30.22 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  31.19 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  30.67 
 
 		 577 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  32.46 
 
 		 447 aa  160  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  30.9 
 
 		 429 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  29.72 
 
 		 422 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  27.18 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  31.37 
 
 		 967 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.6 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.54 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  28.05 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.32 
 
 		 401 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.19 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  26.07 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  25.65 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  26.43 
 
 		 429 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  26.68 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.82 
 
 		 396 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  25.94 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  24.24 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  23.85 
 
 		 426 aa  93.6  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  26.32 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.69 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  25.39 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  27.4 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  26 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  25.29 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  24.43 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  24.29 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  24.86 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  24.64 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  24.87 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  23.92 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  24.86 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  22.97 
 
 		 429 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  24.27 
 
 		 446 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  27.49 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  23.87 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  24.23 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  24.14 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>