175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1911 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  95.24 
 
 
420 aa  746    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  100 
 
 
433 aa  847    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  69.98 
 
 
421 aa  547  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  67.74 
 
 
404 aa  537  1e-151  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  54.3 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  45.35 
 
 
436 aa  348  1e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  36.29 
 
 
414 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  35.19 
 
 
422 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  38.12 
 
 
417 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  33.26 
 
 
413 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  33.17 
 
 
413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  32.42 
 
 
413 aa  184  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  32.62 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  35.52 
 
 
417 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  34.16 
 
 
397 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  31.98 
 
 
405 aa  170  5e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  33.87 
 
 
384 aa  169  7e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  32.27 
 
 
410 aa  166  8e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  33.17 
 
 
414 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.61 
 
 
405 aa  124  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  29.46 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  34.92 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.54 
 
 
400 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.2 
 
 
419 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  31.03 
 
 
405 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  30.39 
 
 
404 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  28.46 
 
 
429 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  30.46 
 
 
419 aa  99.8  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  28.13 
 
 
465 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.98 
 
 
425 aa  93.6  6e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.13 
 
 
404 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  29.92 
 
 
396 aa  93.2  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.56 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  29.71 
 
 
396 aa  91.7  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.36 
 
 
431 aa  90.5  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  24.64 
 
 
440 aa  90.5  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.76 
 
 
426 aa  89.4  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.11 
 
 
431 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  26.46 
 
 
385 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  26.46 
 
 
385 aa  86.7  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.98 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  26.06 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  24.14 
 
 
421 aa  84.7  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.32 
 
 
427 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.25 
 
 
424 aa  84  0.000000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.93 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  25.98 
 
 
431 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.29 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.65 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.92 
 
 
426 aa  80.9  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.68 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.54 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.42 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  25.27 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  30.41 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  24.43 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.14 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.11 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.11 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  25.19 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  31.91 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  26.29 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  25.39 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.6 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  25.4 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.31 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  24.87 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  25.13 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  33.54 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.73 
 
 
408 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  27.07 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  25.93 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.73 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  24.5 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  23.82 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  23.68 
 
 
422 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  25.79 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  23.06 
 
 
451 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  22.78 
 
 
369 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  25.13 
 
 
577 aa  63.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  24.13 
 
 
441 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  23.63 
 
 
441 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  23.86 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  21.96 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1816  arsenite transport protein  51.92 
 
 
63 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  26.46 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  24.65 
 
 
366 aa  60.1  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  30.23 
 
 
447 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  24.34 
 
 
441 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  24.34 
 
 
441 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  24.31 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  25.82 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  24.31 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.41 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  28.82 
 
 
446 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.84 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  25.67 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  21.93 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  25.93 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  25.93 
 
 
376 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>