More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3669 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  100 
 
 
431 aa  845    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  66.44 
 
 
451 aa  578  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  65.89 
 
 
431 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  57.41 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  57.65 
 
 
428 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  55.56 
 
 
428 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  53.66 
 
 
437 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  52.96 
 
 
437 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  52.96 
 
 
437 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  53.41 
 
 
428 aa  438  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  47.37 
 
 
440 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  46.46 
 
 
421 aa  382  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  46.32 
 
 
419 aa  358  9e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  47.03 
 
 
424 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  45.22 
 
 
441 aa  351  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  44.76 
 
 
441 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  44.92 
 
 
431 aa  347  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  45.48 
 
 
451 aa  346  6e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  44.57 
 
 
440 aa  339  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  46.19 
 
 
427 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  44.47 
 
 
423 aa  338  8e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  45.69 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  45.45 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  42.76 
 
 
423 aa  335  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  43.85 
 
 
441 aa  335  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  44.52 
 
 
427 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  45.22 
 
 
441 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  44.52 
 
 
441 aa  328  9e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  42.42 
 
 
426 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  42.32 
 
 
440 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  44.32 
 
 
441 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  44.29 
 
 
441 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  44.29 
 
 
441 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  44.29 
 
 
441 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  44.29 
 
 
441 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  44.18 
 
 
427 aa  324  2e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  44.39 
 
 
424 aa  321  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  43.62 
 
 
441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  43.62 
 
 
444 aa  320  3e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  44.08 
 
 
441 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  44.08 
 
 
444 aa  319  7e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  44.08 
 
 
444 aa  319  7e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  44.08 
 
 
444 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  44.08 
 
 
444 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  43.16 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  42.89 
 
 
415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  41.9 
 
 
422 aa  306  4.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  42.03 
 
 
427 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  43.17 
 
 
424 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  42.75 
 
 
422 aa  285  8e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.32 
 
 
577 aa  282  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  37.3 
 
 
425 aa  275  8e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  38.23 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  40.63 
 
 
417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  38.33 
 
 
429 aa  259  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  36.07 
 
 
447 aa  253  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  33.8 
 
 
429 aa  251  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  38.07 
 
 
967 aa  249  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  36.81 
 
 
429 aa  246  4.9999999999999997e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  35.17 
 
 
422 aa  234  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.73 
 
 
408 aa  224  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  30.91 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  34.26 
 
 
421 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.06 
 
 
421 aa  183  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  31.57 
 
 
444 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  31.57 
 
 
444 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  29.06 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  32.15 
 
 
445 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  30.16 
 
 
447 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  30.89 
 
 
445 aa  151  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  27.95 
 
 
428 aa  147  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  31.16 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  30.43 
 
 
446 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.95 
 
 
422 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  29.76 
 
 
408 aa  143  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  31.11 
 
 
414 aa  144  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  28.41 
 
 
409 aa  143  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.55 
 
 
405 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  33.11 
 
 
434 aa  139  7e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.5 
 
 
400 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.76 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  28.78 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.82 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  29.34 
 
 
447 aa  133  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.03 
 
 
411 aa  124  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  27.25 
 
 
404 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  25.51 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.04 
 
 
402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  29.27 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.54 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  27.23 
 
 
384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.82 
 
 
405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  31.19 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  27.67 
 
 
419 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  27.49 
 
 
410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  25.49 
 
 
417 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.92 
 
 
414 aa  113  6e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  30.79 
 
 
429 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>