210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0353 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  100 
 
 		 409 aa  790    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  34.34 
 
 		 421 aa  203  6e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.33 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  33.41 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  33.41 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  35.21 
 
 		 408 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  32.12 
 
 		 421 aa  192  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  32.06 
 
 		 425 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  30.26 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  29.82 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  34.72 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  30.03 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  31.37 
 
 		 431 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.44 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  30.53 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  28.41 
 
 		 431 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  29.82 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  29.26 
 
 		 440 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  27.96 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  28.09 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  28.03 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  30.03 
 
 		 424 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.09 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  27.67 
 
 		 415 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  31.41 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  32.15 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  25.88 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.08 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  29.81 
 
 		 967 aa  139  7.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  30 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.56 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  28.61 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.88 
 
 		 431 aa  136  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.46 
 
 		 437 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.46 
 
 		 437 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.17 
 
 		 437 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.93 
 
 		 451 aa  132  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.81 
 
 		 427 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.25 
 
 		 440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.36 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  25.74 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  29.15 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.55 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  28.06 
 
 		 441 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  26.94 
 
 		 441 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  26.1 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  114  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  27.56 
 
 		 577 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  25.9 
 
 		 440 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  27.56 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  27.68 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  27.3 
 
 		 441 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  26.39 
 
 		 444 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  27.03 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 441 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  26.11 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  26.11 
 
 		 444 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  25.87 
 
 		 441 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  25.87 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  25.87 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  27.57 
 
 		 405 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.17 
 
 		 401 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  25.06 
 
 		 422 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.93 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  22.94 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.78 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  25.34 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  23.84 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  22.73 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.23 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  22.41 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  21.53 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  21.31 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  22.09 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  21.02 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  22.87 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  22.73 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  22.88 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  23.85 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  25.99 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  25.14 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  23.5 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  20.55 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  20.44 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  24.29 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  24.04 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  21.97 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  23.98 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  21.64 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  23.71 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  23.71 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  23.71 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  21.92 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>