More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0610 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  100 
 
 
429 aa  840    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  40.24 
 
 
422 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  38.73 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  38.26 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  38 
 
 
424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  39.18 
 
 
419 aa  273  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  40.1 
 
 
427 aa  272  7e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  39.81 
 
 
424 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  38.5 
 
 
441 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  38.19 
 
 
423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  37.12 
 
 
421 aa  269  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  35.71 
 
 
423 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  39.06 
 
 
440 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  37.56 
 
 
437 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  37.56 
 
 
437 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  37.83 
 
 
431 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  40.41 
 
 
427 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  38.94 
 
 
431 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  38.85 
 
 
440 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  34.85 
 
 
440 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  38.97 
 
 
441 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  38.97 
 
 
441 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  38.3 
 
 
451 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  40.53 
 
 
424 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  35.98 
 
 
429 aa  259  6e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  36.67 
 
 
451 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  37.88 
 
 
427 aa  259  9e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  38.73 
 
 
441 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  38.73 
 
 
441 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  38.5 
 
 
441 aa  256  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  39.07 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  39.07 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  39.07 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  38.26 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  39.07 
 
 
441 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  34.91 
 
 
426 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  38.28 
 
 
425 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  38.73 
 
 
444 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  38.73 
 
 
441 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  38.73 
 
 
444 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  38.73 
 
 
444 aa  249  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  38.73 
 
 
444 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  38.63 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  37.94 
 
 
441 aa  246  6e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  34.19 
 
 
428 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  38.03 
 
 
444 aa  245  9e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  38.03 
 
 
444 aa  245  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  38.26 
 
 
441 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  38.98 
 
 
422 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  36.05 
 
 
425 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  39.95 
 
 
427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  36.14 
 
 
417 aa  240  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  37.09 
 
 
415 aa  238  1e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  34.69 
 
 
428 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  36.22 
 
 
577 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  35.42 
 
 
428 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  36.04 
 
 
429 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  37.22 
 
 
408 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  35.49 
 
 
422 aa  213  7e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  34.57 
 
 
429 aa  213  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  31.62 
 
 
421 aa  203  6e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  32.35 
 
 
967 aa  202  8e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  33.71 
 
 
447 aa  200  5e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  29.75 
 
 
421 aa  196  6e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  31.42 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  30.03 
 
 
409 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  29.64 
 
 
422 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  30.62 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  25.12 
 
 
424 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  28.14 
 
 
444 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  28.14 
 
 
444 aa  153  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  28.99 
 
 
445 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.38 
 
 
419 aa  147  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  26.88 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  29.51 
 
 
401 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  29.83 
 
 
445 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  30.4 
 
 
411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.2 
 
 
405 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  27.66 
 
 
405 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  27.25 
 
 
436 aa  125  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  28.28 
 
 
447 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.99 
 
 
400 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  27.18 
 
 
447 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  30.35 
 
 
434 aa  120  6e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  28.68 
 
 
429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  28.28 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  28.43 
 
 
429 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.54 
 
 
408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.64 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  25.3 
 
 
414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  26.02 
 
 
404 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  24.87 
 
 
402 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  28.99 
 
 
418 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.57 
 
 
417 aa  100  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  28.29 
 
 
405 aa  100  5e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.32 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  27.01 
 
 
421 aa  98.2  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  23.76 
 
 
404 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  24.32 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  24.29 
 
 
417 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>