221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2344 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  85.25 
 
 		 429 aa  685    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  84.54 
 
 		 429 aa  677    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  84.27 
 
 		 429 aa  673    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 427 aa  823    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  77.7 
 
 		 427 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  79.81 
 
 		 429 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  85.48 
 
 		 429 aa  687    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  84.04 
 
 		 429 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  81.92 
 
 		 429 aa  658    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  96.16 
 
 		 427 aa  779    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  99.77 
 
 		 427 aa  821    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  82.63 
 
 		 429 aa  699    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  84.51 
 
 		 429 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  74.94 
 
 		 427 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 		 427 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  73.11 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  72.33 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  74.05 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  72.09 
 
 		 427 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  77.89 
 
 		 428 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  70.74 
 
 		 435 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  76.9 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  71.36 
 
 		 426 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  71.19 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  71.91 
 
 		 426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  72.91 
 
 		 427 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  69.73 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  70.46 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  70.21 
 
 		 427 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  71.66 
 
 		 430 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  69.29 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  66.99 
 
 		 434 aa  521  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  58.39 
 
 		 429 aa  491  9.999999999999999e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  61.54 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  66.58 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  60.79 
 
 		 434 aa  481  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  64.37 
 
 		 433 aa  480  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  60.86 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  60.86 
 
 		 436 aa  475  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  62.86 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  61.41 
 
 		 434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  56.03 
 
 		 430 aa  468  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  55.08 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  55.08 
 
 		 430 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  62.53 
 
 		 431 aa  463  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  62.38 
 
 		 431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  59.38 
 
 		 434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  59.47 
 
 		 438 aa  437  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  59.33 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  50.96 
 
 		 432 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  53.94 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  49.16 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  46.24 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  47.69 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  46.86 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  40.88 
 
 		 419 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  31.53 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  31.53 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  31.06 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.91 
 
 		 452 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  31.06 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  30.82 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  30.82 
 
 		 452 aa  209  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  30.82 
 
 		 452 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  30.82 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  30.82 
 
 		 452 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  32.26 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  32.26 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  44.55 
 
 		 239 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  31.16 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.3 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  29.19 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  30.81 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  31.82 
 
 		 419 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  29.28 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  31.37 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  27.88 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  27.35 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  28.25 
 
 		 416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  31.27 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  32.54 
 
 		 417 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  31.27 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  26.63 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  25.42 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.94 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  26.27 
 
 		 417 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  31.27 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  27.09 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  25.29 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  25.29 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  28.97 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  27.58 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  27.22 
 
 		 423 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>