229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0932 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  100 
 
 
432 aa  843    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  52.35 
 
 
429 aa  440  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  52.29 
 
 
419 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  50.47 
 
 
430 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  50.7 
 
 
430 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  50.7 
 
 
430 aa  426  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  51.45 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  49.65 
 
 
429 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
429 aa  403  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  49.28 
 
 
427 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  48.23 
 
 
427 aa  402  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
429 aa  402  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  50.48 
 
 
427 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  50.12 
 
 
428 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  49.05 
 
 
427 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  50.96 
 
 
427 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  49.41 
 
 
429 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  48.79 
 
 
427 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  47.66 
 
 
435 aa  392  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  50.96 
 
 
427 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  50.84 
 
 
430 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  49.17 
 
 
429 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  49.88 
 
 
427 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  48.94 
 
 
429 aa  391  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  49.17 
 
 
429 aa  390  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  48.94 
 
 
429 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  48.58 
 
 
429 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  50.25 
 
 
427 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  49.64 
 
 
427 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  49.03 
 
 
427 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  48.79 
 
 
428 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  48.71 
 
 
430 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  47.92 
 
 
427 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  47.95 
 
 
430 aa  375  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  48.55 
 
 
426 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  45.78 
 
 
433 aa  375  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  48.79 
 
 
430 aa  373  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  45.03 
 
 
433 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  48.31 
 
 
426 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  49.28 
 
 
429 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  49.16 
 
 
419 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  47.82 
 
 
428 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  48.79 
 
 
429 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  45.11 
 
 
438 aa  358  8e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  46.23 
 
 
438 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  47.02 
 
 
434 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  44.58 
 
 
436 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  44.58 
 
 
436 aa  356  5e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  46.65 
 
 
434 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  46.25 
 
 
417 aa  355  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  46.67 
 
 
434 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  47.47 
 
 
431 aa  345  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  46.75 
 
 
431 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  44 
 
 
421 aa  344  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  45.2 
 
 
434 aa  340  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  45.7 
 
 
433 aa  333  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  45.37 
 
 
434 aa  332  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  29.42 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  29.42 
 
 
452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.02 
 
 
452 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  33.94 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  33.94 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  29.5 
 
 
452 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  29.39 
 
 
452 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  29.39 
 
 
452 aa  194  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  30.09 
 
 
426 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  29.46 
 
 
452 aa  193  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  29.46 
 
 
452 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  29.28 
 
 
452 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  29.05 
 
 
452 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  29.23 
 
 
419 aa  176  7e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  35.5 
 
 
239 aa  175  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.71 
 
 
424 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  30.17 
 
 
424 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  28.1 
 
 
424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  26.82 
 
 
422 aa  136  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  26.82 
 
 
422 aa  133  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  25.67 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  25.72 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  26.94 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  24.29 
 
 
422 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  25.27 
 
 
415 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.92 
 
 
428 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  25.98 
 
 
423 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  24.88 
 
 
414 aa  123  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  25.96 
 
 
424 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  27.1 
 
 
417 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  27.52 
 
 
417 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  23.47 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  24.88 
 
 
415 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  24.36 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  25.14 
 
 
417 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  25.75 
 
 
421 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  23.19 
 
 
417 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>