125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1590 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
239 aa  438  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  47.71 
 
 
427 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  39.65 
 
 
430 aa  195  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  39.21 
 
 
429 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  46.82 
 
 
427 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  47.25 
 
 
427 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  45.87 
 
 
435 aa  188  8e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  47.49 
 
 
430 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  45.41 
 
 
427 aa  187  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
427 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  45.91 
 
 
429 aa  184  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  45.91 
 
 
429 aa  184  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  49.26 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  43.93 
 
 
430 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  38.33 
 
 
430 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  38.33 
 
 
430 aa  183  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  43.64 
 
 
429 aa  182  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  46.98 
 
 
427 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  44.55 
 
 
427 aa  181  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  47.6 
 
 
429 aa  180  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  45.45 
 
 
429 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  178  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  43.93 
 
 
427 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  35.5 
 
 
432 aa  175  6e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  45.87 
 
 
436 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  45.87 
 
 
436 aa  175  7e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  46.54 
 
 
438 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  45 
 
 
429 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  47.98 
 
 
428 aa  171  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  43.26 
 
 
426 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  43.75 
 
 
433 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  43.91 
 
 
434 aa  170  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  45.28 
 
 
430 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  41.35 
 
 
426 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  44.55 
 
 
427 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  44.55 
 
 
429 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  45.93 
 
 
428 aa  168  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  50.93 
 
 
438 aa  168  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  45.45 
 
 
428 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  47.12 
 
 
427 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  39.52 
 
 
430 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  45.83 
 
 
434 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  44.5 
 
 
429 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  42.66 
 
 
431 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  42.11 
 
 
434 aa  159  4e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  45.67 
 
 
427 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  47.78 
 
 
427 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  46.15 
 
 
427 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  38.97 
 
 
434 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  40.55 
 
 
433 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  35.05 
 
 
417 aa  152  5e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  43.4 
 
 
431 aa  151  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  34.82 
 
 
421 aa  148  6e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  40.64 
 
 
434 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  36.95 
 
 
419 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  31.58 
 
 
419 aa  136  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  107  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  32.98 
 
 
452 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  32.45 
 
 
452 aa  105  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  32.98 
 
 
452 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  37.65 
 
 
428 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  37.65 
 
 
428 aa  102  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.77 
 
 
424 aa  87  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  35.33 
 
 
424 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1103  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  59.65 
 
 
70 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557257  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  32.93 
 
 
424 aa  81.6  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  30.64 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  30.65 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  38.13 
 
 
427 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  31.54 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  30 
 
 
417 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  31.52 
 
 
417 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  30.48 
 
 
416 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  31.67 
 
 
422 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  32.1 
 
 
417 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5376  Arsenical pump membrane protein  36.42 
 
 
396 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.82 
 
 
428 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  32.88 
 
 
414 aa  57.8  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  36.84 
 
 
417 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  33.94 
 
 
415 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  28.48 
 
 
417 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  28.48 
 
 
417 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  32.61 
 
 
424 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  34.4 
 
 
411 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  31.25 
 
 
422 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  31.48 
 
 
422 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>