112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1103 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1103  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  100 
 
 		 70 aa  142  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  92.45 
 
 		 431 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  92.31 
 
 		 431 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  88.68 
 
 		 430 aa  103  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  85.45 
 
 		 434 aa  101  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  80.36 
 
 		 434 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  84.91 
 
 		 438 aa  97.8  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  84.91 
 
 		 434 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  78.57 
 
 		 427 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  78.57 
 
 		 427 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  80.77 
 
 		 436 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  80.77 
 
 		 436 aa  96.7  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  78.85 
 
 		 434 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 		 429 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  75.47 
 
 		 427 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  75.47 
 
 		 427 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  74.07 
 
 		 428 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  76.92 
 
 		 429 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 		 427 aa  90.1  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 		 435 aa  88.2  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  87.8  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  87.8  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  69.49 
 
 		 429 aa  86.7  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  69.09 
 
 		 430 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  69.49 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  69.64 
 
 		 429 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  73.58 
 
 		 429 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  73.58 
 
 		 428 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 427 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 427 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 427 aa  85.9  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  77.36 
 
 		 434 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  73.58 
 
 		 428 aa  85.9  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  69.23 
 
 		 430 aa  85.1  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 		 430 aa  84.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  59.65 
 
 		 239 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  69.81 
 
 		 427 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  64.41 
 
 		 427 aa  84  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  66.07 
 
 		 430 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  66.07 
 
 		 430 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  67.8 
 
 		 429 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  65.45 
 
 		 432 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  69.81 
 
 		 426 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  78.72 
 
 		 433 aa  80.9  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  61.82 
 
 		 438 aa  80.5  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  69.23 
 
 		 426 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  64.15 
 
 		 419 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  80.43 
 
 		 433 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  69.23 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  76.09 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  66.04 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  77.27 
 
 		 427 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  62.75 
 
 		 417 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  66.67 
 
 		 430 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  67.31 
 
 		 433 aa  74.3  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  61.82 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  61.82 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  52.73 
 
 		 421 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  48.28 
 
 		 419 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  48.28 
 
 		 424 aa  57.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  48.28 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  50.98 
 
 		 417 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  43.64 
 
 		 427 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  44.83 
 
 		 424 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  41.67 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  48.08 
 
 		 423 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  41.67 
 
 		 452 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  41.67 
 
 		 452 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  38.6 
 
 		 416 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  46.15 
 
 		 417 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  38.6 
 
 		 428 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  43.1 
 
 		 426 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  46.94 
 
 		 422 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  42.31 
 
 		 415 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  42.31 
 
 		 417 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  44.9 
 
 		 422 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  41.54 
 
 		 417 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  44.9 
 
 		 422 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  44.9 
 
 		 417 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  46.67 
 
 		 417 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  42.86 
 
 		 422 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  42.86 
 
 		 423 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  42.59 
 
 		 414 aa  45.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  44.68 
 
 		 423 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>