241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  82.49 
 
 
427 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  78.92 
 
 
427 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  100 
 
 
427 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  98.31 
 
 
427 aa  753    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  82.49 
 
 
427 aa  668    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  80.05 
 
 
427 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  75.59 
 
 
427 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  79.39 
 
 
427 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  76.27 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  69.56 
 
 
429 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  70.5 
 
 
427 aa  586  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  70.42 
 
 
429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  70.42 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  72.33 
 
 
427 aa  579  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  75.64 
 
 
428 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  72.37 
 
 
429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  70.87 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  69.95 
 
 
427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  70.73 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  72.13 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  69.98 
 
 
435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  69.09 
 
 
427 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  72.13 
 
 
429 aa  571  1.0000000000000001e-162  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  69.72 
 
 
427 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  69.72 
 
 
429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  70.02 
 
 
429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  71.19 
 
 
426 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  74.09 
 
 
428 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  73.85 
 
 
428 aa  553  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  70.15 
 
 
433 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  69.67 
 
 
430 aa  531  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  65.05 
 
 
430 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  68.04 
 
 
430 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  63.64 
 
 
434 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  63.31 
 
 
438 aa  490  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  66.01 
 
 
433 aa  486  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  61.19 
 
 
436 aa  482  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  61.19 
 
 
436 aa  482  1e-135  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  60.47 
 
 
434 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  67.72 
 
 
429 aa  479  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  66.26 
 
 
431 aa  480  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  61.5 
 
 
434 aa  476  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  66.83 
 
 
431 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  52.35 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  52.11 
 
 
430 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  58.51 
 
 
434 aa  450  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  62.29 
 
 
434 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  50.36 
 
 
430 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  50.36 
 
 
430 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  58.78 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  49.17 
 
 
432 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  53.94 
 
 
430 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  54.52 
 
 
433 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  47.8 
 
 
417 aa  380  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  47.22 
 
 
419 aa  364  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  46.17 
 
 
421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  42.03 
 
 
419 aa  333  4e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  33.18 
 
 
428 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  33.18 
 
 
428 aa  209  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  30.23 
 
 
452 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  29.23 
 
 
452 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  29.23 
 
 
452 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  30.23 
 
 
452 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  28.84 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  28.77 
 
 
452 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  28.77 
 
 
452 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  28.77 
 
 
452 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  27.92 
 
 
452 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  31.49 
 
 
426 aa  191  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  29 
 
 
452 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  47.42 
 
 
239 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  29.68 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  30.29 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  34.44 
 
 
419 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  28.74 
 
 
424 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  30.85 
 
 
415 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  30.22 
 
 
424 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  30.31 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  34.88 
 
 
417 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  30.49 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  29.35 
 
 
422 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  30.14 
 
 
422 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  30.14 
 
 
422 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  30.03 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  30.03 
 
 
417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  30.35 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.29 
 
 
422 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  29.44 
 
 
428 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  28.92 
 
 
417 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  31.22 
 
 
417 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  32.39 
 
 
427 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  32.15 
 
 
419 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  31.33 
 
 
415 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  30.92 
 
 
413 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>