247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4221 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
422 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  77.32 
 
 
422 aa  586  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  76.83 
 
 
422 aa  556  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  76.83 
 
 
422 aa  551  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  76.66 
 
 
423 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  78.05 
 
 
423 aa  545  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  62.77 
 
 
424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  59.38 
 
 
423 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  65.21 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  61.81 
 
 
417 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  60.71 
 
 
417 aa  438  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  60.24 
 
 
428 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  57.75 
 
 
415 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  62.66 
 
 
417 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  59.76 
 
 
416 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  56.35 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  57.95 
 
 
419 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  57.77 
 
 
417 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  55.83 
 
 
417 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  55.83 
 
 
417 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  56.89 
 
 
419 aa  354  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  55.83 
 
 
424 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  32.1 
 
 
424 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.86 
 
 
424 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  32.28 
 
 
426 aa  189  8e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  32.32 
 
 
424 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.17 
 
 
419 aa  169  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  27.45 
 
 
430 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  33.58 
 
 
427 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  34.55 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  26.89 
 
 
429 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  26.63 
 
 
430 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  26.63 
 
 
430 aa  133  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  26.52 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  25 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  35.93 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  31.19 
 
 
413 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  27.15 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  28.24 
 
 
426 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  28.8 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  26.05 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  29.51 
 
 
427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.07 
 
 
438 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  29.7 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  27.83 
 
 
426 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  27.84 
 
 
427 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  32.66 
 
 
411 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  32.66 
 
 
411 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  27.01 
 
 
433 aa  113  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  28.57 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  31.09 
 
 
411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  29.37 
 
 
435 aa  111  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  28.11 
 
 
427 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
427 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.47 
 
 
434 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  32.6 
 
 
421 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  28.98 
 
 
433 aa  109  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  25.47 
 
 
417 aa  108  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  26.95 
 
 
434 aa  109  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  29.06 
 
 
428 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  28.3 
 
 
427 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  28.68 
 
 
430 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  26.46 
 
 
427 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  29.4 
 
 
429 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  30.63 
 
 
413 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  25.8 
 
 
419 aa  107  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  26.4 
 
 
429 aa  106  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  28.46 
 
 
427 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  28.07 
 
 
427 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  31.59 
 
 
411 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  26.4 
 
 
429 aa  105  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  26.76 
 
 
436 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  26.76 
 
 
436 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  26.09 
 
 
427 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  26.42 
 
 
429 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  27.22 
 
 
434 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  27.01 
 
 
430 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  26.68 
 
 
429 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  27.73 
 
 
427 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  25.54 
 
 
427 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  29.2 
 
 
431 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  26.25 
 
 
429 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  27.35 
 
 
434 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  25.84 
 
 
429 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  28.03 
 
 
428 aa  99.8  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  28.08 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  26.29 
 
 
429 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  25.81 
 
 
429 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  27.07 
 
 
430 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.91 
 
 
417 aa  96.3  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
429 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  26.27 
 
 
434 aa  96.3  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  29.6 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  25.31 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>