285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3540 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 424 aa  814    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  63.02 
 
 		 422 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  62.29 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  62.47 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  62.22 
 
 		 422 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  55.45 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  56.27 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  60.05 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  61.48 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  54.74 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  58.53 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  54.94 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  55.64 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  55.05 
 
 		 415 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  56.59 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  56.16 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  57.14 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  55.01 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  55.01 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  57.8 
 
 		 419 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  53.19 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  56.05 
 
 		 424 aa  316  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  33.02 
 
 		 424 aa  206  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  33.01 
 
 		 424 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  35.8 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  34.83 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  34.6 
 
 		 424 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  27.38 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  27.36 
 
 		 429 aa  153  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  28.61 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  31.9 
 
 		 426 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  29.95 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  31.71 
 
 		 426 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  27.1 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  28.7 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  30.36 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  25.12 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  25.12 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  36.49 
 
 		 417 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  29.76 
 
 		 427 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  29.49 
 
 		 430 aa  137  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  29.76 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  28.1 
 
 		 427 aa  136  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  28.24 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  28.4 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  30 
 
 		 427 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  29.76 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  28.17 
 
 		 427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  29.35 
 
 		 438 aa  130  3e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  30.05 
 
 		 427 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  29.47 
 
 		 429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  30.34 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  29.25 
 
 		 429 aa  129  8.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  27.32 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  29.74 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  29.25 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  27.79 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  30.19 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  30.91 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  29.53 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  32.25 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  28.25 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  27.43 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  28.02 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  33.07 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  33.07 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  27.32 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  29.1 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  28.17 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  28.5 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  30.49 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  30.49 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.55 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.35 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  33.07 
 
 		 411 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  31.11 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  27.94 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  28.81 
 
 		 434 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  27.66 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  27.91 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  32.24 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  29.91 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.58 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  27.98 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  26.85 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  26.85 
 
 		 436 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  30.63 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  27.64 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.56 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  33.42 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2976  arsenical pump membrane protein  31.98 
 
 		 396 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  25.45 
 
 		 441 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>