228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0313 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
417 aa  813    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  70.2 
 
 
419 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  60.34 
 
 
421 aa  504  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  50.48 
 
 
429 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  50.71 
 
 
430 aa  408  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  50.13 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  48.45 
 
 
430 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  48.45 
 
 
430 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  48.58 
 
 
429 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  48.58 
 
 
427 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  50 
 
 
427 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  48.66 
 
 
427 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
429 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  48.83 
 
 
434 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  47.71 
 
 
427 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  47.3 
 
 
427 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  46.34 
 
 
427 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  47.8 
 
 
427 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  46.04 
 
 
427 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  48.1 
 
 
429 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  47.71 
 
 
427 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  48.46 
 
 
429 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  46.79 
 
 
435 aa  365  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  46.49 
 
 
430 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  368  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  47.8 
 
 
427 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  46.79 
 
 
429 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  48.22 
 
 
429 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  46.97 
 
 
433 aa  363  3e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  48.22 
 
 
429 aa  362  7.0000000000000005e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  47.8 
 
 
427 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  49.39 
 
 
429 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  47.63 
 
 
427 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  48.19 
 
 
434 aa  360  2e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  43.44 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  49.28 
 
 
434 aa  358  9.999999999999999e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  43.44 
 
 
436 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  46.67 
 
 
430 aa  358  9.999999999999999e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  47.39 
 
 
427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  48.78 
 
 
428 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  45.75 
 
 
432 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  46.08 
 
 
430 aa  354  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  46.08 
 
 
428 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  48.54 
 
 
428 aa  353  4e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  47.07 
 
 
426 aa  349  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  42.14 
 
 
433 aa  348  8e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  43.3 
 
 
438 aa  347  3e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  46.47 
 
 
429 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  46.47 
 
 
431 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  46.48 
 
 
434 aa  343  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  47.32 
 
 
426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  44.63 
 
 
434 aa  334  2e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  45.28 
 
 
431 aa  331  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  44.23 
 
 
438 aa  327  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  47.28 
 
 
433 aa  319  3.9999999999999996e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  40.15 
 
 
419 aa  306  4.0000000000000004e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  38.16 
 
 
428 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  38.16 
 
 
428 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  31.63 
 
 
452 aa  206  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  31.4 
 
 
452 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.93 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  32.33 
 
 
452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  32.33 
 
 
452 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  32.09 
 
 
452 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  32.09 
 
 
452 aa  196  6e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  31.86 
 
 
452 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  31.86 
 
 
452 aa  192  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  32.09 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  31.01 
 
 
424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  32.62 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  29.06 
 
 
419 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  36.16 
 
 
239 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  29.16 
 
 
424 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  26.84 
 
 
417 aa  126  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  25.75 
 
 
415 aa  112  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  26.06 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.28 
 
 
419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  27.25 
 
 
424 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  26.33 
 
 
419 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  25.77 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  25.47 
 
 
422 aa  109  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  25.26 
 
 
423 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  24.87 
 
 
428 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  23.87 
 
 
429 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.61 
 
 
384 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  24.72 
 
 
416 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  24.19 
 
 
413 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  24.39 
 
 
417 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  27.02 
 
 
427 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.18 
 
 
441 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  24.58 
 
 
411 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  24.58 
 
 
411 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>