200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04270 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  100 
 
 		 384 aa  699    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2763  Arsenical pump membrane protein  57.34 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000394857 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3063  arsenical pump membrane protein  59.76 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271488  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  50.67 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3328  Arsenical pump membrane protein  55.34 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.453205  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2549  Arsenical pump membrane protein  48.17 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.907959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2976  arsenical pump membrane protein  43.5 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  43.88 
 
 		 381 aa  192  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  27.87 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  32.4 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  35.41 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  35.41 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  32.38 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.45 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  32.89 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  32.37 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  38.42 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  29.01 
 
 		 426 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  36.76 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  32.41 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  32.41 
 
 		 436 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  27.23 
 
 		 417 aa  127  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  29.85 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  32.02 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  25.9 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  25.45 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  25.45 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  27.05 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  35.26 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  29.4 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  31.94 
 
 		 427 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  29.47 
 
 		 427 aa  119  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  29.57 
 
 		 426 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  37.17 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.77 
 
 		 419 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  33.16 
 
 		 423 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  31.28 
 
 		 434 aa  116  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  37.39 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  27.82 
 
 		 434 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  25.12 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  31.61 
 
 		 438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  31.28 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  29.14 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  31.01 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  37.92 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  28.88 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  33.43 
 
 		 417 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  30.13 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  28.75 
 
 		 424 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  32.42 
 
 		 427 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  28.72 
 
 		 429 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  29.72 
 
 		 429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  31.54 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  28.46 
 
 		 429 aa  110  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  28.32 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  29.82 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  28.99 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  33.17 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  29.07 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  29.79 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  28.61 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  28.01 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  28.21 
 
 		 429 aa  106  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  28.1 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  31.61 
 
 		 438 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  30.54 
 
 		 434 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  31.78 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  30.26 
 
 		 431 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  33.8 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  31.5 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  33.33 
 
 		 417 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  31.56 
 
 		 422 aa  104  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  38.16 
 
 		 415 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  31.43 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  30.81 
 
 		 427 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  30.79 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  25.51 
 
 		 421 aa  99.8  7e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  32.49 
 
 		 419 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  28.05 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0889  Arsenical pump membrane protein  37.33 
 
 		 423 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  32.49 
 
 		 422 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  30.36 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  32.58 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  32.22 
 
 		 422 aa  96.7  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  28.88 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  29.63 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  29.37 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  30.13 
 
 		 428 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  22.09 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  31.99 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  29.28 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  29.28 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>