217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0889 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0889  Arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 423 aa  794    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  53.24 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  46.01 
 
 		 427 aa  269  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  47.52 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  47.52 
 
 		 411 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  47.52 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  43.44 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  47.44 
 
 		 421 aa  249  8e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  45.94 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5376  Arsenical pump membrane protein  42.89 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  45.84 
 
 		 413 aa  216  4e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  27.79 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  31.51 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  32.33 
 
 		 428 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  30.83 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  27.86 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  28.97 
 
 		 424 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  30.18 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  30.69 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  29.23 
 
 		 424 aa  117  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  30.42 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  36.11 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  31.75 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  29.34 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  26.07 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  26.84 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  28.92 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  25.29 
 
 		 426 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  30.06 
 
 		 422 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  32.17 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2763  Arsenical pump membrane protein  35.01 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000394857 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  31.2 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  28.28 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  22.25 
 
 		 429 aa  97.1  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  37.04 
 
 		 384 aa  97.4  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  25.4 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  33.8 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  32.44 
 
 		 381 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  30.58 
 
 		 422 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  26.43 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  26.22 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  30.66 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  26.7 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  23.6 
 
 		 432 aa  94.4  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  29.97 
 
 		 414 aa  94.7  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  28.14 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  28.35 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  26.61 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  27.06 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  26.97 
 
 		 435 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  24.48 
 
 		 426 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.51 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  25.45 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2976  arsenical pump membrane protein  30.86 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  26.13 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  25.89 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  25.33 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  25.89 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  25.33 
 
 		 427 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  26.23 
 
 		 427 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  28.21 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  27.42 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  26.13 
 
 		 429 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  25.36 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  25.89 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  29.59 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  27.61 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  25.64 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  21.69 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  21.69 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  28.31 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  29.53 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  23.16 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.56 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  26.37 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  25.27 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  25.61 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  22.52 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3328  Arsenical pump membrane protein  32.95 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.453205  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  25.8 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  28.93 
 
 		 430 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  21.66 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  26.65 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  21.28 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.57 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  20.38 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  27.68 
 
 		 427 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  28.21 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  23.8 
 
 		 434 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  24.07 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  26.72 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  27.68 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>