More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_780 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  84.43 
 
 		 424 aa  705    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  82.55 
 
 		 424 aa  655    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  100 
 
 		 424 aa  825    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  40.34 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  35.64 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  32.35 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  34.08 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  28.77 
 
 		 429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  31 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  32.3 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  28.77 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  31.07 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  32.21 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  33.89 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  32.67 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  30.7 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  31.69 
 
 		 435 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  29.18 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  29.18 
 
 		 430 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  33.33 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  29.57 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  33.52 
 
 		 416 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  30.3 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  28.99 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  33.01 
 
 		 430 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  30.95 
 
 		 426 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  31.61 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  33.69 
 
 		 422 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  29.95 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  29.95 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  30.58 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  29.86 
 
 		 427 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  30.12 
 
 		 427 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  30.58 
 
 		 429 aa  172  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  33.17 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  32.84 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  32.13 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  33.69 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  30.3 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  32.01 
 
 		 430 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  30.41 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  30.34 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  30.41 
 
 		 428 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  29.12 
 
 		 429 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  31.86 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  31.86 
 
 		 417 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  28.71 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  29.62 
 
 		 428 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  30.71 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  29.34 
 
 		 427 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  30.99 
 
 		 417 aa  162  7e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  31.49 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  30.31 
 
 		 429 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  30.02 
 
 		 427 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  30.35 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  31.18 
 
 		 431 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  28.43 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  29.34 
 
 		 427 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  29.3 
 
 		 429 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  29.74 
 
 		 429 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  28.51 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  30.14 
 
 		 438 aa  160  5e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.34 
 
 		 434 aa  159  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 		 429 aa  160  6e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  32.85 
 
 		 419 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.45 
 
 		 438 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  29.51 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  30.3 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  28.2 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  30.3 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  27.78 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  28.81 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  29.45 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  29.29 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  31.19 
 
 		 423 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  26.64 
 
 		 434 aa  145  9e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  29.45 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  31.72 
 
 		 424 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  28.78 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  28.18 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  28.18 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  28.36 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  33.43 
 
 		 417 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  26.6 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  29.08 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  28.41 
 
 		 452 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  27.56 
 
 		 452 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  28.25 
 
 		 452 aa  132  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  27.95 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  27.95 
 
 		 452 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  27.33 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>