225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1139 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
434 aa  835    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  66.82 
 
 
427 aa  554  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  66.51 
 
 
429 aa  553  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  68.18 
 
 
427 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
427 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  67.21 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  67.21 
 
 
429 aa  539  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
427 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  535  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  62.73 
 
 
427 aa  537  1e-151  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  534  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  66.74 
 
 
429 aa  532  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  66.51 
 
 
429 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  66.51 
 
 
429 aa  527  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  65.81 
 
 
428 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  65.35 
 
 
427 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  66.98 
 
 
429 aa  524  1e-147  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  63.55 
 
 
427 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  62.15 
 
 
435 aa  511  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  66.99 
 
 
429 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  63.64 
 
 
427 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  63.55 
 
 
426 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  64.29 
 
 
430 aa  506  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  64.45 
 
 
427 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  64.78 
 
 
427 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  62.92 
 
 
433 aa  504  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  63.16 
 
 
427 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  66.51 
 
 
428 aa  498  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  66.51 
 
 
428 aa  499  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  63.16 
 
 
426 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  64.23 
 
 
427 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  59.86 
 
 
434 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  62.44 
 
 
427 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  60.19 
 
 
430 aa  464  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  61.25 
 
 
430 aa  462  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  63.11 
 
 
433 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  56.6 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  56.6 
 
 
436 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  58.31 
 
 
434 aa  458  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  53.15 
 
 
429 aa  451  1e-125  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  58.77 
 
 
434 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  54.74 
 
 
438 aa  441  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  58.33 
 
 
431 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  59.57 
 
 
429 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  50.58 
 
 
430 aa  430  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  58.03 
 
 
431 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  57.53 
 
 
434 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  50.93 
 
 
430 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  50.93 
 
 
430 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  53.26 
 
 
438 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  46.99 
 
 
432 aa  389  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  50.24 
 
 
419 aa  388  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  48.19 
 
 
417 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  50.84 
 
 
430 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  45.98 
 
 
433 aa  359  7e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  43.36 
 
 
421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  41.23 
 
 
419 aa  324  2e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  33.56 
 
 
428 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  33.56 
 
 
428 aa  192  9e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  28.44 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  28.44 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  28.67 
 
 
452 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  28.67 
 
 
452 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  27.99 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  28.67 
 
 
452 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  28.67 
 
 
452 aa  180  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  28.51 
 
 
452 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  28.51 
 
 
452 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  30.54 
 
 
426 aa  176  9e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  29.44 
 
 
424 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  28.29 
 
 
452 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  32.47 
 
 
419 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  39.37 
 
 
239 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  27.57 
 
 
424 aa  153  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  29.91 
 
 
424 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  27.4 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.79 
 
 
419 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  31.83 
 
 
415 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  27.35 
 
 
417 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 
411 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  27.05 
 
 
416 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 
411 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  28.53 
 
 
424 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  27.95 
 
 
423 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  26.83 
 
 
422 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  30.21 
 
 
419 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  27.35 
 
 
415 aa  103  7e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.96 
 
 
422 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  30.5 
 
 
427 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.15 
 
 
431 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  30.14 
 
 
411 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.3 
 
 
428 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  28.13 
 
 
411 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  28.49 
 
 
417 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>