253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4821 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
411 aa  763    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
411 aa  763    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  97.21 
 
 
411 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  71.71 
 
 
413 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  70.28 
 
 
411 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  57.73 
 
 
427 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  63.85 
 
 
413 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  55.5 
 
 
415 aa  345  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5376  Arsenical pump membrane protein  49.49 
 
 
396 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  51.82 
 
 
421 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0889  Arsenical pump membrane protein  47.86 
 
 
423 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  27.78 
 
 
426 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  40.73 
 
 
379 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  40.48 
 
 
417 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  33.85 
 
 
428 aa  143  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  32.5 
 
 
419 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  34.87 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  37.31 
 
 
419 aa  140  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  34.63 
 
 
417 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  34.63 
 
 
417 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  33.09 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2763  Arsenical pump membrane protein  38.16 
 
 
395 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000394857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  35.16 
 
 
415 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3328  Arsenical pump membrane protein  40.27 
 
 
382 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.453205  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  32.56 
 
 
422 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  27.75 
 
 
424 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  31.29 
 
 
427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  33.67 
 
 
417 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  30.62 
 
 
429 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  34.03 
 
 
423 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  35.28 
 
 
416 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  33.16 
 
 
423 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  32.99 
 
 
424 aa  124  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  26.81 
 
 
424 aa  123  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  35.85 
 
 
381 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  33.42 
 
 
417 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  33.93 
 
 
422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  25.61 
 
 
419 aa  120  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  22.91 
 
 
421 aa  120  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  26.57 
 
 
424 aa  119  7e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  23.83 
 
 
417 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  31.43 
 
 
438 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  30.14 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  33.59 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  34.19 
 
 
422 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  31.27 
 
 
427 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  24.07 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  35.66 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  32.32 
 
 
417 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  31.27 
 
 
427 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  35.99 
 
 
384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  27.33 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  30.81 
 
 
427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  29.09 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  35.82 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  29.09 
 
 
429 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  32.14 
 
 
427 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  29.11 
 
 
435 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  29.26 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  28.16 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  30.65 
 
 
434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  32.68 
 
 
423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  30.33 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  32.29 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  24.07 
 
 
430 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  30.42 
 
 
427 aa  110  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 
429 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  28.85 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  33.67 
 
 
414 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  30.24 
 
 
429 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  24.88 
 
 
430 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 
429 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 
430 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  24.88 
 
 
430 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  29.88 
 
 
427 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  30.24 
 
 
429 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  28.33 
 
 
426 aa  106  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  29.09 
 
 
429 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  31.57 
 
 
427 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  26.23 
 
 
430 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 
428 aa  101  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  24.53 
 
 
452 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  27.87 
 
 
433 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  23.04 
 
 
419 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  24.07 
 
 
452 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  24.53 
 
 
452 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  27.88 
 
 
426 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  28.09 
 
 
429 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  24.07 
 
 
452 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  28.54 
 
 
436 aa  99.8  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  24.53 
 
 
452 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  29.57 
 
 
427 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  28.54 
 
 
436 aa  99.8  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  24.07 
 
 
452 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>