229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3798 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 426 aa  831    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  95.87 
 
 		 426 aa  761    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  81.8 
 
 		 427 aa  662    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  76.06 
 
 		 427 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  75.59 
 
 		 427 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  71.22 
 
 		 427 aa  597  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  73.62 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  72.54 
 
 		 427 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  73.38 
 
 		 427 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  68.78 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  72.3 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  73.71 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  71.36 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  71.13 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  72.77 
 
 		 428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  70.19 
 
 		 429 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  68.32 
 
 		 435 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  67.14 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  72.91 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  73.37 
 
 		 428 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  71.19 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  71.67 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  72.88 
 
 		 428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  69.01 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  69.48 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 		 429 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  66.34 
 
 		 433 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  66.59 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  65.05 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  63.16 
 
 		 434 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  58.57 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  58.57 
 
 		 436 aa  480  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  59.77 
 
 		 434 aa  478  1e-133  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  58.03 
 
 		 438 aa  476  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  54.48 
 
 		 429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  63.35 
 
 		 429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  61.99 
 
 		 430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  59.15 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  62.35 
 
 		 433 aa  463  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  54.25 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  53.66 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  53.66 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  61.17 
 
 		 431 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  61.74 
 
 		 431 aa  448  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  59.23 
 
 		 434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  57.11 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  58.23 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  50.13 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  48.23 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  47.86 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  45.07 
 
 		 421 aa  371  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  47.32 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  46.73 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  41.5 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  34.02 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  34.02 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  30.25 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  30.25 
 
 		 452 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  30.25 
 
 		 452 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  30.25 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  30.25 
 
 		 452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  30.02 
 
 		 452 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  30.02 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 		 452 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  29.79 
 
 		 452 aa  196  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  31.31 
 
 		 424 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  29.79 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  43.64 
 
 		 239 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.41 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  30.66 
 
 		 426 aa  173  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  27.92 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  29.33 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  31.11 
 
 		 424 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  29.13 
 
 		 415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  30 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  31.06 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  30.08 
 
 		 428 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  29.89 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  29.18 
 
 		 417 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  28.79 
 
 		 422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  29.36 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  29.36 
 
 		 417 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  30.3 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  29.3 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.59 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  28.61 
 
 		 417 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  27.34 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  29.8 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  28.27 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  31.59 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>