225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1215 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  85.21 
 
 
429 aa  683    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  84.31 
 
 
429 aa  715    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  85.68 
 
 
429 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  77.75 
 
 
427 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  85.45 
 
 
429 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  86.38 
 
 
429 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  96.24 
 
 
427 aa  772    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  81.5 
 
 
429 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  82.9 
 
 
429 aa  670    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
427 aa  827    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  96.48 
 
 
427 aa  777    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  85.68 
 
 
429 aa  688    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  86.62 
 
 
429 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  75.64 
 
 
427 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  75.35 
 
 
427 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  74.35 
 
 
428 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  72.86 
 
 
427 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  77.4 
 
 
428 aa  590  1e-167  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  70.98 
 
 
435 aa  588  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  72.57 
 
 
427 aa  587  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  72.33 
 
 
427 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  76.41 
 
 
428 aa  585  1e-166  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  70.63 
 
 
426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  71.19 
 
 
433 aa  577  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  70.7 
 
 
427 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  70.99 
 
 
427 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  71.43 
 
 
426 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  73.12 
 
 
429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  72.66 
 
 
427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  70.22 
 
 
427 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  72.04 
 
 
430 aa  554  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  69.53 
 
 
430 aa  544  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  66.99 
 
 
434 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  59.34 
 
 
429 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  61.3 
 
 
438 aa  496  1e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  66.58 
 
 
429 aa  491  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  61.34 
 
 
436 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  61.34 
 
 
436 aa  485  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  60.14 
 
 
434 aa  482  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  56.26 
 
 
430 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  62.62 
 
 
430 aa  475  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  56.26 
 
 
430 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  56.03 
 
 
430 aa  474  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  63.64 
 
 
433 aa  473  1e-132  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  60.32 
 
 
434 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  62.77 
 
 
431 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  62.62 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  59.38 
 
 
434 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  60.19 
 
 
438 aa  443  1e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  59.33 
 
 
434 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  51.18 
 
 
432 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  54.45 
 
 
430 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  46.48 
 
 
421 aa  379  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  48.93 
 
 
433 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  48.66 
 
 
417 aa  378  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  47.46 
 
 
419 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  40.39 
 
 
419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  31.29 
 
 
452 aa  216  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  31.29 
 
 
452 aa  216  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  30.82 
 
 
452 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  30.82 
 
 
452 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  30.82 
 
 
452 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.44 
 
 
452 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  30.82 
 
 
452 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  30.59 
 
 
452 aa  206  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  30.59 
 
 
452 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  30.59 
 
 
452 aa  196  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  31.71 
 
 
428 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  31.71 
 
 
428 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  45.45 
 
 
239 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  31.48 
 
 
426 aa  177  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.07 
 
 
424 aa  173  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  30.81 
 
 
424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  29.38 
 
 
424 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  31.82 
 
 
419 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  28.73 
 
 
424 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  27.88 
 
 
417 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  26.82 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  26.33 
 
 
422 aa  114  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  32.54 
 
 
417 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  30.77 
 
 
411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  27.6 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  25.7 
 
 
417 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  26.36 
 
 
415 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  30.25 
 
 
417 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  26.33 
 
 
422 aa  107  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  25.58 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  25.58 
 
 
417 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  26.33 
 
 
422 aa  104  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  30.42 
 
 
411 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  30.42 
 
 
411 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  26.26 
 
 
422 aa  102  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  25.71 
 
 
417 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  27.05 
 
 
423 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>