261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6054 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 423 aa  824    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  59.27 
 
 		 422 aa  455  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  57.28 
 
 		 417 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  56.83 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  57.88 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  59.08 
 
 		 419 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  60.1 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  57.07 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  59.61 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  57.07 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  55.53 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  57.88 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  54.7 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  56.86 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  52.21 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  57.42 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  54.26 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  56.78 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  53.5 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  53.5 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  52.83 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  53.68 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  32.42 
 
 		 424 aa  192  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  33.58 
 
 		 426 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  32.67 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  34.16 
 
 		 419 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  34.15 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  26.21 
 
 		 430 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  25.84 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  32.92 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  27.18 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  25.98 
 
 		 432 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  27.25 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  34.53 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  30.95 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  24.58 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  24.58 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  32.99 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  31.12 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  27.32 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  27.79 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  32.16 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  32.16 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  25.26 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  30.23 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  28.91 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  28.81 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  28.93 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  28.32 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  29.54 
 
 		 427 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  28.45 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  33.08 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  31.34 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  29.7 
 
 		 411 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 427 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  28.71 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  26.37 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  28.89 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  27.22 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  27.22 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  26.26 
 
 		 429 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  26.78 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  27.56 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  27.56 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.71 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  24.87 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  24.87 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  32.64 
 
 		 381 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  26.26 
 
 		 429 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  27.25 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.52 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  27.51 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  27.12 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  26.61 
 
 		 427 aa  100  7e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  29.25 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  27.53 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  26.94 
 
 		 438 aa  98.6  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  25.14 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  25.98 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  26.75 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  27.25 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  32.23 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  31.35 
 
 		 379 aa  97.1  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.55 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0476  arsenical pump membrane protein  25.21 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.06 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  25.41 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  26.58 
 
 		 429 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  26.85 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.55 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2976  arsenical pump membrane protein  29.81 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  32.89 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  25.21 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>