233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2858 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
436 aa  841    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  100 
 
 
436 aa  841    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  71.5 
 
 
438 aa  554  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  68.2 
 
 
434 aa  548  1e-155  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  71.26 
 
 
430 aa  549  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  72.87 
 
 
431 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  68.12 
 
 
434 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  71.73 
 
 
431 aa  514  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  66.82 
 
 
434 aa  513  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  70.75 
 
 
434 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  63.02 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  61.28 
 
 
427 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  61.56 
 
 
427 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  61.16 
 
 
427 aa  488  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  61.54 
 
 
427 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  63.28 
 
 
429 aa  485  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  60.52 
 
 
427 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  60.52 
 
 
427 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  62.56 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  62.79 
 
 
429 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  62.33 
 
 
429 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  62.68 
 
 
427 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  62.7 
 
 
429 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  61.45 
 
 
428 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  60.32 
 
 
435 aa  478  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  62.79 
 
 
429 aa  472  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  60.57 
 
 
427 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  60.84 
 
 
427 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  59.05 
 
 
426 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  64.43 
 
 
430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  61.76 
 
 
433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  60.61 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  63.25 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  62.56 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  63.25 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  61.28 
 
 
427 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  62.33 
 
 
429 aa  466  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  60.81 
 
 
427 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  58.94 
 
 
427 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  58.67 
 
 
426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  62.41 
 
 
430 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  58.47 
 
 
429 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  52.91 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  62.82 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  56.71 
 
 
434 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  50.93 
 
 
430 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  50.93 
 
 
430 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  51.17 
 
 
430 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  59.09 
 
 
433 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  55.96 
 
 
438 aa  403  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  53.21 
 
 
430 aa  401  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  48.73 
 
 
433 aa  368  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  44.62 
 
 
432 aa  362  1e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  43.44 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  43.71 
 
 
419 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  40.09 
 
 
421 aa  331  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  36.79 
 
 
419 aa  292  8e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  30.35 
 
 
452 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  30.35 
 
 
452 aa  213  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  29.69 
 
 
452 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  29.69 
 
 
452 aa  206  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  29.69 
 
 
452 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  29.48 
 
 
452 aa  205  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  29.48 
 
 
452 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  28.98 
 
 
452 aa  203  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  29.04 
 
 
452 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  32.21 
 
 
428 aa  202  9e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  32.21 
 
 
428 aa  202  9e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  29.04 
 
 
452 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  47.14 
 
 
239 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.48 
 
 
424 aa  182  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  30 
 
 
426 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.72 
 
 
419 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  30.54 
 
 
424 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  28.15 
 
 
424 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  29.65 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  29.77 
 
 
415 aa  117  6e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  27.99 
 
 
422 aa  106  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  26.76 
 
 
422 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  26.98 
 
 
417 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  27.42 
 
 
416 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  26.79 
 
 
428 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.18 
 
 
421 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  25.25 
 
 
423 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1103  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  82.14 
 
 
70 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557257  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  31.96 
 
 
384 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  28.26 
 
 
422 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.75 
 
 
451 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  27.61 
 
 
417 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  27.99 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  31.32 
 
 
417 aa  97.8  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  27.32 
 
 
414 aa  96.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  29.22 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  27.85 
 
 
419 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>