More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0719 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  100 
 
 
451 aa  892    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  66.44 
 
 
431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  62.31 
 
 
431 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  54.98 
 
 
428 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  51.7 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  51.7 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  52.15 
 
 
437 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  52.94 
 
 
428 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  51.58 
 
 
429 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  51.13 
 
 
428 aa  418  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  44.69 
 
 
441 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  45.5 
 
 
421 aa  372  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  44.47 
 
 
441 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  45.61 
 
 
440 aa  358  8e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  44.67 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  44.91 
 
 
441 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  44.91 
 
 
441 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  44.25 
 
 
441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  44.47 
 
 
441 aa  349  7e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  43.81 
 
 
441 aa  346  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  43.36 
 
 
441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  43.36 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  43.36 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  43.36 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  43.36 
 
 
441 aa  343  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  44.03 
 
 
441 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  42.92 
 
 
423 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  43.88 
 
 
440 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  43.58 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  43.58 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  44.03 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  44.03 
 
 
444 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  44.03 
 
 
441 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  44.03 
 
 
444 aa  335  7e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  44.03 
 
 
444 aa  335  7e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  45.12 
 
 
419 aa  335  7e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  43.81 
 
 
444 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  41.76 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  42.83 
 
 
423 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  42.95 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  43.09 
 
 
424 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  43.54 
 
 
427 aa  311  1e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  41.89 
 
 
427 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  40.57 
 
 
440 aa  310  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  41.83 
 
 
426 aa  310  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  44.02 
 
 
422 aa  309  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  41.12 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  41.46 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  39.6 
 
 
415 aa  296  7e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  40.69 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  37.33 
 
 
425 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  39.63 
 
 
417 aa  277  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  38 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  40.35 
 
 
577 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  39.06 
 
 
422 aa  263  4e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  37.1 
 
 
967 aa  253  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  36.53 
 
 
429 aa  249  8e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  34.66 
 
 
429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  35.25 
 
 
447 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  33.41 
 
 
429 aa  216  7e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  33.7 
 
 
422 aa  216  8e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  32.13 
 
 
408 aa  203  4e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  34.66 
 
 
421 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  33.87 
 
 
421 aa  192  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  31.23 
 
 
421 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  31.94 
 
 
424 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  30.3 
 
 
445 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  30.07 
 
 
428 aa  157  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  28.73 
 
 
444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  28.73 
 
 
444 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  29.31 
 
 
447 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.78 
 
 
422 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  27.83 
 
 
446 aa  146  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.79 
 
 
408 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  29.02 
 
 
401 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  29.01 
 
 
400 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  30.52 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  30.32 
 
 
447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  26.93 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  28.67 
 
 
465 aa  131  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  27.39 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  26.44 
 
 
405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  27.38 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  28.63 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  26.61 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  24.66 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  28.99 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  24.45 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  25.12 
 
 
396 aa  110  7.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  25.98 
 
 
419 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  25.58 
 
 
430 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  24.65 
 
 
417 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  28.94 
 
 
413 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  23.88 
 
 
413 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.63 
 
 
436 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  24.75 
 
 
436 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  24.75 
 
 
436 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.64 
 
 
402 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  23.64 
 
 
413 aa  103  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  29.51 
 
 
429 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>