233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1929 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  100 
 
 
427 aa  825    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  74.18 
 
 
429 aa  635    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  78.4 
 
 
427 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  78.4 
 
 
427 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  76.02 
 
 
427 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  75.06 
 
 
427 aa  624  1e-177  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  75.78 
 
 
427 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
429 aa  618  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  77.23 
 
 
428 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
429 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  75.18 
 
 
427 aa  616  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  75 
 
 
426 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  75.54 
 
 
427 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  74.94 
 
 
427 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  76.03 
 
 
427 aa  609  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  74.88 
 
 
429 aa  608  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  74.65 
 
 
429 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  74.65 
 
 
429 aa  605  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  74.18 
 
 
427 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  73 
 
 
429 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  75.3 
 
 
426 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  73.77 
 
 
429 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  76.6 
 
 
427 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  78.21 
 
 
429 aa  598  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  69.72 
 
 
427 aa  597  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  73.94 
 
 
429 aa  600  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  76.27 
 
 
428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  75.79 
 
 
428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  67.85 
 
 
435 aa  573  1.0000000000000001e-162  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  70.02 
 
 
430 aa  549  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  68.52 
 
 
433 aa  548  1e-155  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  68.93 
 
 
430 aa  531  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  68.18 
 
 
434 aa  533  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  62.35 
 
 
438 aa  510  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  62.38 
 
 
436 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  62.38 
 
 
436 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  66.58 
 
 
433 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  65.78 
 
 
429 aa  490  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  64.41 
 
 
430 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  61.57 
 
 
434 aa  481  1e-134  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  63.59 
 
 
431 aa  472  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  54.48 
 
 
429 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  62.95 
 
 
431 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  60.23 
 
 
434 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  52.36 
 
 
430 aa  455  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  60.67 
 
 
434 aa  451  1e-125  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  52.48 
 
 
430 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  52.48 
 
 
430 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  60.62 
 
 
434 aa  440  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  57.82 
 
 
438 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  50.35 
 
 
432 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  52.16 
 
 
430 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  50 
 
 
417 aa  388  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  48.81 
 
 
433 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  46.39 
 
 
421 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  47.46 
 
 
419 aa  363  3e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  40.19 
 
 
419 aa  322  7e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  33.71 
 
 
428 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  33.71 
 
 
428 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  30.02 
 
 
452 aa  199  7e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  29.98 
 
 
452 aa  199  9e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  29.49 
 
 
452 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  29.26 
 
 
452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  29.26 
 
 
452 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  29.26 
 
 
452 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  29.26 
 
 
452 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.11 
 
 
452 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  29.03 
 
 
452 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  47.27 
 
 
239 aa  192  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  32.13 
 
 
426 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  29.03 
 
 
452 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.65 
 
 
419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.71 
 
 
424 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  29.09 
 
 
424 aa  156  7e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  29.83 
 
 
424 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  30.28 
 
 
424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  30.56 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  28.41 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  28.46 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  29.36 
 
 
417 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.65 
 
 
419 aa  113  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  30.16 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  32.22 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  28.3 
 
 
422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  29.8 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  29.39 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  29.39 
 
 
417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  32.46 
 
 
417 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  32.21 
 
 
411 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  32.21 
 
 
411 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  28.93 
 
 
417 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.93 
 
 
422 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  29.15 
 
 
414 aa  104  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.07 
 
 
421 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>