224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2769 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  82.08 
 
 		 433 aa  661    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 435 aa  833    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  69.79 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  70.78 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  71.19 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  70.53 
 
 		 427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  70.53 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  69.28 
 
 		 429 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  70.71 
 
 		 427 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  70.73 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  69.05 
 
 		 429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  68.91 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  68.82 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  68.59 
 
 		 429 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  66.97 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  67.67 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  69.64 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  68.36 
 
 		 429 aa  564  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  68.36 
 
 		 429 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  68.62 
 
 		 429 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  68.18 
 
 		 426 aa  554  1e-157  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  70.47 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  70 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  71.6 
 
 		 428 aa  548  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  71.36 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  69.93 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  70.17 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  69.17 
 
 		 427 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  68.02 
 
 		 426 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  69.49 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  67.99 
 
 		 430 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  65.78 
 
 		 430 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  62.88 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  64.62 
 
 		 433 aa  479  1e-134  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  62.03 
 
 		 434 aa  480  1e-134  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  54.19 
 
 		 429 aa  475  1e-133  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  65.31 
 
 		 431 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  65.54 
 
 		 429 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  60.09 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  60.09 
 
 		 436 aa  472  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  64.2 
 
 		 430 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  61.19 
 
 		 434 aa  470  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  54.27 
 
 		 430 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  59.4 
 
 		 434 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  66.11 
 
 		 431 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  61.81 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  51.73 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  51.73 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  58.87 
 
 		 434 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  58.88 
 
 		 438 aa  438  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  47.72 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  51.02 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  50.93 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  47.02 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  44.58 
 
 		 421 aa  365  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  46.63 
 
 		 417 aa  364  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  37.84 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  33.79 
 
 		 428 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  33.79 
 
 		 428 aa  202  6e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  30.41 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  30.41 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.41 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  29.36 
 
 		 452 aa  201  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  29.2 
 
 		 452 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  29.43 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  29.2 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  29.2 
 
 		 452 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  29.43 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  33.33 
 
 		 426 aa  192  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  45.91 
 
 		 239 aa  188  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  28.97 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  34.59 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  31.69 
 
 		 424 aa  180  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  31.52 
 
 		 424 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  30.57 
 
 		 424 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  30.42 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  29.66 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  31.38 
 
 		 415 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  30.42 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  28.53 
 
 		 424 aa  120  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  35.76 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  31.37 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  30.03 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  30.03 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.34 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  30.58 
 
 		 416 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  30.52 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.81 
 
 		 422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  28.75 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  29.89 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  29.38 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  32.28 
 
 		 384 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  34.04 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>