More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3002 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 414 aa  783    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  65.25 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  64 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  60.1 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  61.31 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  59.3 
 
 		 417 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 422 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  60.43 
 
 		 416 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  63.09 
 
 		 422 aa  420  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2332  Arsenical pump membrane protein  64.74 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  59.95 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  58.15 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1991  arsenical pump membrane protein  64.25 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722795  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  58.06 
 
 		 417 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  56.75 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  57.6 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  57.39 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  57.39 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  54.68 
 
 		 419 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  58.65 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  53.02 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  55.94 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  32.6 
 
 		 426 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  33.5 
 
 		 424 aa  195  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  32.84 
 
 		 424 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  32.93 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.42 
 
 		 419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  27.21 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  26.1 
 
 		 430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  34.63 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  26.23 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  26.23 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  25.12 
 
 		 432 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  30.99 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  27.75 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  30.47 
 
 		 427 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  28.71 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  31.07 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  27.93 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  30.75 
 
 		 435 aa  123  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  25.54 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  26.11 
 
 		 430 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  29.28 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  28.79 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  29.46 
 
 		 427 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  28.23 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  25.44 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  28.93 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  27.67 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  29.31 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  26.76 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  35.94 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  26.36 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  26.36 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  28.87 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.07 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  28.87 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  28.16 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  29.01 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  29.17 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  32.98 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  26.91 
 
 		 429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  32.98 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  27.66 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  31.83 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  29.59 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  27.18 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  27.07 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  27.18 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  26.91 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  27.64 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  26.72 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  29.16 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  27.59 
 
 		 438 aa  106  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  30.94 
 
 		 427 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  25.77 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  25.77 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  29.43 
 
 		 427 aa  104  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  26.72 
 
 		 429 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  28.64 
 
 		 428 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  26.34 
 
 		 452 aa  102  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  30.93 
 
 		 431 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  26.35 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  32.46 
 
 		 411 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  28.76 
 
 		 429 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  28.57 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  26.82 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  25.64 
 
 		 452 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  27.49 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  25.88 
 
 		 452 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>