170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3356 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  100 
 
 
427 aa  799    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  56.67 
 
 
415 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  56.8 
 
 
413 aa  364  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  58.54 
 
 
411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  58.54 
 
 
411 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  57.54 
 
 
411 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  54.59 
 
 
411 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  56.7 
 
 
413 aa  324  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5376  Arsenical pump membrane protein  51.13 
 
 
396 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  53.13 
 
 
421 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0889  Arsenical pump membrane protein  47.62 
 
 
423 aa  229  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  30.17 
 
 
424 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  33.83 
 
 
422 aa  149  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  32.77 
 
 
419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  29.44 
 
 
424 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  39.22 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  33.67 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  28.67 
 
 
424 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  26.57 
 
 
426 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  25.7 
 
 
429 aa  124  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  32.2 
 
 
417 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  32.38 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  36.96 
 
 
379 aa  119  9e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  26.92 
 
 
419 aa  117  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  25 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  31.67 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  26.78 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  33.09 
 
 
422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  31.54 
 
 
417 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  31.54 
 
 
417 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  25.76 
 
 
430 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  25.76 
 
 
430 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  32.6 
 
 
422 aa  114  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.32 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  24.49 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  31.83 
 
 
427 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  35.81 
 
 
419 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  31.83 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  31.22 
 
 
423 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  29.65 
 
 
430 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2763  Arsenical pump membrane protein  34.82 
 
 
395 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000394857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  29.44 
 
 
417 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  31.67 
 
 
427 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  30.53 
 
 
427 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  31.67 
 
 
427 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3328  Arsenical pump membrane protein  41.3 
 
 
382 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.453205  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  30.67 
 
 
417 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  28.82 
 
 
416 aa  107  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  29.26 
 
 
435 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3991  arsenite permease  32.42 
 
 
419 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0830422  normal  0.159952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  34.83 
 
 
381 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.44 
 
 
384 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  30.68 
 
 
424 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  23.68 
 
 
421 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  28.36 
 
 
417 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  27.05 
 
 
430 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  29.09 
 
 
429 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  30.05 
 
 
428 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  33.78 
 
 
433 aa  100  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  28.97 
 
 
436 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  28.97 
 
 
436 aa  99.8  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  28.06 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  29.32 
 
 
434 aa  99.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  30 
 
 
426 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  30.09 
 
 
434 aa  99  2e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  27.54 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  29.15 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.84 
 
 
438 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  28.74 
 
 
426 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  30.77 
 
 
414 aa  97.8  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2976  arsenical pump membrane protein  32.75 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  31.16 
 
 
429 aa  95.1  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  31.5 
 
 
429 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  31.16 
 
 
429 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  27.95 
 
 
434 aa  93.2  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  28.73 
 
 
427 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  28.64 
 
 
431 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  28.73 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  27.7 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  29.15 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
429 aa  90.1  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  30.59 
 
 
429 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  33.67 
 
 
424 aa  89  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  27.65 
 
 
429 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  27.31 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  29.51 
 
 
428 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  29.09 
 
 
429 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  28.94 
 
 
428 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  27.82 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  28.64 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  28.61 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  24.06 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  24.06 
 
 
452 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  24.62 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>