223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1528 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  100 
 
 
419 aa  819    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  70.2 
 
 
417 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  56.25 
 
 
421 aa  462  1e-129  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  51.19 
 
 
429 aa  418  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  53.69 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  49.52 
 
 
430 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  48.34 
 
 
429 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  48.67 
 
 
430 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  48.67 
 
 
430 aa  387  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  48.82 
 
 
432 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  47.87 
 
 
429 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
435 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  46.68 
 
 
427 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  48.1 
 
 
429 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  47.16 
 
 
429 aa  371  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  48.44 
 
 
427 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  48.34 
 
 
429 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  47.58 
 
 
427 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  48.34 
 
 
429 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  47.84 
 
 
427 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  47.54 
 
 
434 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  46.68 
 
 
429 aa  362  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  50.24 
 
 
434 aa  362  8e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  48.1 
 
 
429 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  46.25 
 
 
433 aa  359  6e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  45.5 
 
 
427 aa  358  9e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  47.89 
 
 
427 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  47.46 
 
 
427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  47.33 
 
 
430 aa  355  7.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  47.22 
 
 
427 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  44.12 
 
 
438 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  47.49 
 
 
427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  43.81 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  43.81 
 
 
436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  46.45 
 
 
427 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  47.94 
 
 
429 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  46.81 
 
 
427 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  44.52 
 
 
433 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  46.49 
 
 
427 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  46 
 
 
430 aa  349  6e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  47.82 
 
 
429 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  46.45 
 
 
428 aa  346  4e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  46.76 
 
 
434 aa  346  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  47.09 
 
 
426 aa  342  9e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  46.1 
 
 
430 aa  339  5e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  46.24 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  47.46 
 
 
428 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  47.7 
 
 
428 aa  335  9e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  46.73 
 
 
426 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  44.83 
 
 
427 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  43.34 
 
 
419 aa  329  6e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  44.08 
 
 
438 aa  328  8e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  45.15 
 
 
431 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  45.04 
 
 
431 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  43.2 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  46.91 
 
 
433 aa  315  8e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  38.94 
 
 
428 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  38.94 
 
 
428 aa  230  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  29.86 
 
 
452 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  30.09 
 
 
452 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  29.48 
 
 
452 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  30.21 
 
 
452 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  30.59 
 
 
452 aa  189  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  30.35 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  30.21 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  30.35 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  30.35 
 
 
452 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  29.98 
 
 
452 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  31.89 
 
 
419 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  29.69 
 
 
424 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  28.67 
 
 
426 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  31.6 
 
 
424 aa  151  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  36.16 
 
 
239 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  27.82 
 
 
424 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  26.68 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.84 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  28.73 
 
 
424 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  27.32 
 
 
417 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  29.13 
 
 
411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  25.36 
 
 
413 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  25.8 
 
 
422 aa  106  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  28.93 
 
 
421 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  28.05 
 
 
414 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  26.76 
 
 
427 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  25.94 
 
 
415 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  26.33 
 
 
417 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  26.33 
 
 
417 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  26.46 
 
 
423 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  25.45 
 
 
411 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  25.45 
 
 
411 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  27.42 
 
 
416 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  23.76 
 
 
415 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  24.25 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>