229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1911 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1380  arsenical pump membrane protein  94.19 
 
 		 431 aa  688    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.0485201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 431 aa  830    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  87.88 
 
 		 430 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  72.38 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  72.38 
 
 		 436 aa  585  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  72.18 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2535  Arsenical pump membrane protein  75.81 
 
 		 434 aa  551  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  71.29 
 
 		 438 aa  551  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  66.51 
 
 		 434 aa  527  1e-148  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  63.93 
 
 		 429 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1487  arsenical pump membrane protein  68.22 
 
 		 430 aa  518  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  65.48 
 
 		 435 aa  519  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  63.47 
 
 		 427 aa  514  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  62.35 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  62.98 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  62.35 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  65.4 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  64.58 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  63.15 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  67.07 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  66.34 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  64.34 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  62.68 
 
 		 427 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  66.34 
 
 		 433 aa  501  1e-141  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  62.82 
 
 		 427 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  63.44 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  62.59 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  65.16 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  63.92 
 
 		 429 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  62.76 
 
 		 429 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  64.98 
 
 		 434 aa  492  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  62.53 
 
 		 429 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  62.53 
 
 		 429 aa  492  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  62.65 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4380  arsenical pump membrane protein  63.76 
 
 		 428 aa  488  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  65.45 
 
 		 428 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  65.21 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  61.41 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  64.32 
 
 		 430 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  62.07 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  61.26 
 
 		 426 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  63.9 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  52.73 
 
 		 429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  62.68 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  52.62 
 
 		 430 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  58.03 
 
 		 434 aa  440  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  51.43 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  51.43 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  55.53 
 
 		 438 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  46.47 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  46.51 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  52.1 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  51.69 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  45.04 
 
 		 419 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  41.78 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  37.92 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4907  arsenical pump family protein  31.22 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5315  putative arsenical pump family protein  31.22 
 
 		 452 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22815e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5017  arsenical pump membrane protein  30.77 
 
 		 452 aa  212  1e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5340  arsenical pump family protein, putative  30.39 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5075  arsenical pump family protein  30.16 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5462  arsenical pump family protein  30.16 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5397  putative arsenical pump family protein  30.39 
 
 		 452 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5613  putative arsenical pump family protein  30.39 
 
 		 452 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.515067  hitchhiker  0.0000000000000195769 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4919  arsenical pump family protein  30.16 
 
 		 452 aa  206  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1321  arsenical pump membrane protein  33.18 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1202  arsenical pump membrane protein  33.18 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5346  putative arsenical pump family protein  30.39 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  31.37 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  32 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  33.5 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1590  arsenical pump membrane protein  43.75 
 
 		 239 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  31.69 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  30.54 
 
 		 424 aa  169  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  32.61 
 
 		 415 aa  142  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  30.08 
 
 		 417 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  29.68 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  29.62 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  28.71 
 
 		 417 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  30.29 
 
 		 417 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.73 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  31.88 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  32.88 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  32.88 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.88 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.19 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  28.27 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  27.86 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  28.61 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1103  Na+/H+ antiporter NhaD and related arsenite permease-like protein  92.86 
 
 		 70 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.557257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  29.65 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  29.4 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  29.4 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>