176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2549 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2549  Arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 355 aa  658    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.907959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3328  Arsenical pump membrane protein  56.01 
 
 		 382 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.453205  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  50.6 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2763  Arsenical pump membrane protein  49.29 
 
 		 395 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000394857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04270  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  50 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2976  arsenical pump membrane protein  45.56 
 
 		 396 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3063  arsenical pump membrane protein  51.38 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0271488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3151  Arsenical pump membrane protein  43.71 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  29.31 
 
 		 426 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4735  arsenical pump membrane protein  39.45 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4821  arsenical pump membrane protein  39.45 
 
 		 411 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5120  arsenical pump membrane protein  40.82 
 
 		 411 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.202597  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5336  arsenical pump membrane protein  39.44 
 
 		 413 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1448  arsenical pump membrane protein  39 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.801307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2216  Arsenical pump membrane protein  36.87 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1047  arsenical pump membrane protein  37.86 
 
 		 417 aa  119  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.288237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  37.7 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  26.98 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  32.49 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2083  arsenical pump membrane protein  39.22 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.964654  normal  0.119821 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  27.15 
 
 		 424 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  32.8 
 
 		 415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  32.24 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  32.39 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  32.39 
 
 		 417 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  33.52 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  31.22 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  25.87 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  31.06 
 
 		 416 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  27.45 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  30.81 
 
 		 427 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  31.74 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  32.5 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  26.12 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  29.78 
 
 		 438 aa  103  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  22.67 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  30.03 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  29.13 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  30.39 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0889  Arsenical pump membrane protein  35.46 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3819  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  32.68 
 
 		 422 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  24 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  24 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03351  arsenite/antimonite transporter  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.809643  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0212  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.11 
 
 		 434 aa  99.8  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4851  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03304  hypothetical protein  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.970777  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0214  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.656406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3704  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3985  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  27.53 
 
 		 429 aa  99.4  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3794  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.146507 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  28.33 
 
 		 433 aa  97.1  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0309  arsenical pump membrane protein  26.98 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  27.32 
 
 		 427 aa  97.1  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1715  arsenical pump membrane protein  30.7 
 
 		 427 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  31.93 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  27.03 
 
 		 424 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  29.43 
 
 		 426 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2344  arsenical pump membrane protein  27.04 
 
 		 427 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0116158  hitchhiker  0.00889141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1503  arsenical pump membrane protein  27.2 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  27.04 
 
 		 427 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  31.11 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  30.05 
 
 		 436 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  30.05 
 
 		 436 aa  92.8  8e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  28.21 
 
 		 429 aa  92.4  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  32.46 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  24.14 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  31.2 
 
 		 422 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  23.04 
 
 		 419 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  28.85 
 
 		 427 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2193  arsenical pump membrane protein  29.92 
 
 		 427 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.575633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  26.48 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  29.36 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  25.27 
 
 		 421 aa  89.7  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  29.36 
 
 		 429 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  28.45 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  24.29 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  28.93 
 
 		 433 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  29.07 
 
 		 429 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  27.38 
 
 		 427 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  30.42 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2847  arsenical pump membrane protein  39.6 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.380631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  32.97 
 
 		 414 aa  84  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1463  arsenical pump membrane protein  26.87 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3798  arsenical pump membrane protein  29.8 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13611  arsenical pump integral membrane protein arsB2  37.25 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.259221 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  32.75 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  29.05 
 
 		 427 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  29.51 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  28.86 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  30.14 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  24.5 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  29.83 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5376  Arsenical pump membrane protein  43.67 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.923409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  28.07 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0476  arsenical pump membrane protein  21.71 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1911  arsenical pump membrane protein  31.02 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>