270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0476 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0476  arsenical pump membrane protein  100 
 
 		 452 aa  890    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  25.27 
 
 		 424 aa  108  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  23.84 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0793  arsenical pump membrane protein  25.22 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2201  Arsenical pump membrane protein  24.87 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.171032  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1088  Arsenical pump membrane protein  22.97 
 
 		 426 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  23.56 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0908  arsenical pump membrane protein, putative  24.73 
 
 		 424 aa  96.7  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.203424  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  23.43 
 
 		 430 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  24.03 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  25.11 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  24.93 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0945  arsenical pump membrane protein  25.22 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0458  Arsenical pump membrane protein  24.44 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000462165  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0313  arsenical pump membrane protein  25.27 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  24.3 
 
 		 430 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  24.3 
 
 		 430 aa  91.7  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3282  arsenical pump membrane protein  24.93 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2769  arsenical pump membrane protein  24.56 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  23.85 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1139  arsenical pump membrane protein  26.21 
 
 		 434 aa  89  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3416  arsenical pump membrane protein  24.93 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  24.41 
 
 		 432 aa  87.8  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.52 
 
 		 424 aa  87.4  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4527  arsenical pump membrane protein  23.36 
 
 		 419 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1656  arsenical pump membrane protein  25.45 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2547  arsenical pump membrane protein  24.21 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.545416  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0955  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  23.94 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0536  Arsenical pump membrane protein  23.12 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  22.77 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  21.19 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  25.76 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  26.32 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  23.84 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00510  expressed protein  22.88 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.388757  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  21.12 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00625  arsenical membrane pump  23.34 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.132136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3356  Arsenical pump membrane protein  22.66 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.294319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3877  Arsenical pump membrane protein  23.37 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3669  arsenical pump membrane protein  23.73 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000751712  decreased coverage  0.0000000000221941 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  23.11 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2399  arsenical pump membrane protein  22.14 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980673 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  21.99 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  24.44 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  24.44 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  24.44 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  24.44 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2479  arsenical pump membrane protein  23.25 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2858  arsenical pump membrane protein  23.25 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2390  arsenical pump membrane protein  24.58 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  24.45 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  24 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  21.83 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0717  arsenical pump membrane protein  25.66 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0284123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  24.45 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0427  arsenical pump membrane protein  25 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1055  Arsenical pump membrane protein  21.84 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1489  arsenical pump membrane protein  23.12 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0227279  normal  0.489913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3078  arsenical pump membrane protein  22.81 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.144685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0903  arsenical pump membrane protein  24.07 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0167853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.69 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  21.67 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2813  arsenical pump membrane protein  24.03 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1682  arsenical pump membrane protein  21.79 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.843584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  22.69 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6495  arsenical pump membrane protein  18.31 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.140016  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6730  arsenical pump membrane protein  18.31 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  normal  0.995982 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4334  Arsenical pump membrane protein  23.87 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.423319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  22.71 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4256  arsenical pump membrane protein  24.78 
 
 		 429 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.215961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35110  ArsB protein  21.24 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6318  arsenical pump membrane protein  18.6 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.24303 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1929  arsenite efflux transporter  23.83 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110099  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2717  arsenite efflux transporter  21.08 
 
 		 427 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  23.88 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  21.58 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1215  arsenical pump membrane protein  23.15 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.81 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2137  arsenical pump membrane protein  22.75 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0695  arsenical pump membrane protein  24.32 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.892424 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.28 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  23.41 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  20.69 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3966  arsenical pump membrane protein  23.55 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  24.45 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2520  arsenical pump membrane protein  24.24 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2963  ArsB protein  20.67 
 
 		 427 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2763  Arsenical pump membrane protein  21.37 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000394857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  23.88 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1857  Arsenical pump membrane protein  21.65 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  24.45 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  24.16 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  26.52 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  23.31 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  24.21 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3002  arsenical pump membrane protein  22.73 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3829  arsenical pump membrane protein  22.45 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00505974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  24.21 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3035  arsenical pump membrane protein  20.49 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  23.72 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>