284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3536 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  100 
 
 		 414 aa  796    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  43.93 
 
 		 413 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  36.8 
 
 		 426 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  37.62 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  36.48 
 
 		 408 aa  206  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  35.04 
 
 		 400 aa  206  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  35.11 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  38.7 
 
 		 421 aa  200  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  34.62 
 
 		 401 aa  196  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  39.34 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  33.66 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  38.67 
 
 		 404 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  34.33 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  36.83 
 
 		 404 aa  172  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  36.48 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  34.45 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.52 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  35.57 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  35.49 
 
 		 413 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  35.57 
 
 		 429 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  32.68 
 
 		 413 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  30.41 
 
 		 422 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  30.46 
 
 		 417 aa  136  7.000000000000001e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  35.57 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  28.65 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  28.27 
 
 		 413 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  29.6 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.41 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  29.48 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  27.93 
 
 		 384 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  29.02 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.37 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.93 
 
 		 424 aa  113  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  27.94 
 
 		 414 aa  112  9e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.87 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.29 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  27.36 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  27.79 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.13 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.41 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.23 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  25.12 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  27.27 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  25 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  25.46 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  25.46 
 
 		 444 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  25.46 
 
 		 441 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  25.46 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  25.46 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  25.46 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  25.58 
 
 		 444 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  25.25 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.64 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  30.26 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  25 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  25.23 
 
 		 441 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.84 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25.33 
 
 		 440 aa  100  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  25.98 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.69 
 
 		 425 aa  99.8  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  24.18 
 
 		 427 aa  99.4  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  24.32 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  25 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.49 
 
 		 426 aa  98.2  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  30.28 
 
 		 378 aa  96.7  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.89 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  25.28 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  24.55 
 
 		 441 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.71 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  24.32 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  29.92 
 
 		 376 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  24.43 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  31.12 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  31.12 
 
 		 376 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.29 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.11 
 
 		 451 aa  93.2  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  25.59 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.41 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  24.2 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  22.61 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  24.77 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  30.55 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  26.52 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.06 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  30.77 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  30.84 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  24.46 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  27.48 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  26.49 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  22.22 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  26.17 
 
 		 404 aa  86.3  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  31.14 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  25.38 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  26.21 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  23.2 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  28.01 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  25.94 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>