287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1426 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  100 
 
 
417 aa  804    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  50.5 
 
 
414 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  56.14 
 
 
414 aa  394  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  51.23 
 
 
422 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  54.52 
 
 
413 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  53.37 
 
 
397 aa  360  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  45.5 
 
 
410 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  41.65 
 
 
413 aa  288  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  41.15 
 
 
413 aa  286  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  44.68 
 
 
384 aa  275  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  39.32 
 
 
411 aa  246  4e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  38.31 
 
 
417 aa  241  1e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  37.2 
 
 
405 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  33.65 
 
 
436 aa  199  7e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  38.04 
 
 
404 aa  183  6e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  34.26 
 
 
421 aa  176  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  34.76 
 
 
433 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  34.75 
 
 
452 aa  171  2e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  34.68 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  31.2 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  31.71 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  30.32 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  32.04 
 
 
405 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  33.33 
 
 
413 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  34.75 
 
 
418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.93 
 
 
419 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  32.53 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  28.29 
 
 
440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  32.35 
 
 
429 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  32 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  26.85 
 
 
408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  31.74 
 
 
421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  28.71 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  31.44 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.19 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  28.51 
 
 
428 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.16 
 
 
429 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.27 
 
 
419 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  26.24 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  28.24 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.23 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.94 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  26.32 
 
 
423 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  29.05 
 
 
414 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  27.27 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  27.63 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.87 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  26.11 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  27.48 
 
 
427 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  26.36 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.32 
 
 
427 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.61 
 
 
451 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  27.07 
 
 
424 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  26.29 
 
 
428 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.33 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  27.36 
 
 
440 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  26.9 
 
 
577 aa  86.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  27.39 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  24.26 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  28.8 
 
 
422 aa  84  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.95 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  25.41 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  25.41 
 
 
437 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  28.01 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.13 
 
 
437 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  25.59 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  24.78 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  30.75 
 
 
378 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  25 
 
 
440 aa  79  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  25.29 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  26.97 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.88 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  24.18 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  24.18 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  24.18 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  24.18 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  24.18 
 
 
441 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  24.34 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  26.92 
 
 
441 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  26.62 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  26.62 
 
 
444 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  27.68 
 
 
428 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  24.11 
 
 
451 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  26.69 
 
 
444 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.24 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  29.1 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  28.21 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  27.56 
 
 
416 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  25.85 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  26.65 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  30.41 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  30.41 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  26.28 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  26.28 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  31.7 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  26.28 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  24.91 
 
 
441 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  28.19 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  28.36 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  29.18 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>