More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0803 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  100 
 
 		 397 aa  768    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  60.1 
 
 		 414 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  50.64 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  53.37 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  51.24 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  50.38 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  47.79 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  44.56 
 
 		 413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  44.3 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  44.02 
 
 		 410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  38.62 
 
 		 411 aa  235  9e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  37.69 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  36.05 
 
 		 405 aa  220  3e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  35.41 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  35.81 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  35.52 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  34.92 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  33.92 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  32.16 
 
 		 452 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  37.3 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  36.19 
 
 		 400 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  33.08 
 
 		 405 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  33.16 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  35.86 
 
 		 396 aa  142  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  32.66 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.76 
 
 		 419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  30.05 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  34.76 
 
 		 396 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.47 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  30.56 
 
 		 421 aa  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.77 
 
 		 404 aa  122  8e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  34.6 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  34.22 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  29.77 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  34.76 
 
 		 429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  31.49 
 
 		 404 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  29.89 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  26.7 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  29.28 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.02 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  28.21 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.31 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  28.61 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  34.83 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  28.13 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  28.32 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2062  arsenite-antimonite efflux pump, ArsB  28.09 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  26.72 
 
 		 428 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  27.58 
 
 		 426 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  29.36 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.6 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  24.64 
 
 		 451 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  29.25 
 
 		 414 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  28.68 
 
 		 431 aa  99.8  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  29.88 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  26.89 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  29.57 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5856  Arsenical pump membrane protein  27.04 
 
 		 416 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  28.61 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0800  hypothetical protein  92.16 
 
 		 76 aa  97.8  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.173103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  27.88 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.41 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  26.23 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  30.21 
 
 		 372 aa  96.3  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  30.45 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  28.01 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  28.01 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  28.01 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  28.85 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  30.45 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  30.45 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  30.1 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  30.1 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  25.95 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  28.32 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  30.1 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  27.21 
 
 		 440 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  28.35 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6054  Arsenical pump membrane protein  27.11 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.110806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  24.81 
 
 		 440 aa  94.4  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  28.54 
 
 		 577 aa  94  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  29.02 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4911  putative arsenite permease  31.79 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.372884 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.52 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3672  arsenical pump membrane protein  27.51 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.517459  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.83 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  28.31 
 
 		 451 aa  92  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.96 
 
 		 437 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  27.9 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.74 
 
 		 428 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  29.2 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  29.2 
 
 		 376 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.32 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  28.06 
 
 		 422 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  28.07 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  27.65 
 
 		 441 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.24 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3540  arsenical pump membrane protein  26.59 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.811733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  27.25 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  27.93 
 
 		 370 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>