220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2824 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  100 
 
 		 372 aa  733    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  100 
 
 		 372 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  98.65 
 
 		 372 aa  722    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  733    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  99.73 
 
 		 372 aa  731    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  99.73 
 
 		 372 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  99.73 
 
 		 372 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  98.39 
 
 		 372 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  98.92 
 
 		 372 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  83.51 
 
 		 370 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  83.24 
 
 		 370 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  83.51 
 
 		 370 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  83.24 
 
 		 370 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  80.05 
 
 		 366 aa  590  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  58.36 
 
 		 370 aa  395  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  48.64 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  48.49 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  48.49 
 
 		 385 aa  299  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  45.97 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  42.69 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  43.16 
 
 		 376 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  41.9 
 
 		 378 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  40.37 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  40.37 
 
 		 377 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  42.51 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  41.9 
 
 		 378 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  40.73 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  41.52 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  42.51 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  42.51 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  40.37 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  40.37 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  40.37 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  40.37 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  40.37 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  40.37 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  38.08 
 
 		 367 aa  166  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  31.41 
 
 		 360 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  26.87 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  26.87 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  26.89 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  26.87 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  25.4 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  25.29 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  31.78 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  25.76 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  30.3 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  25.27 
 
 		 368 aa  110  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  29.12 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  26.57 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  26.49 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  26.12 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  26.36 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  27.91 
 
 		 366 aa  99.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.57 
 
 		 400 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.48 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.73 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.86 
 
 		 405 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.32 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.5 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  29.76 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  28.42 
 
 		 428 aa  86.3  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.55 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  28.65 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.6 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  26.9 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.45 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.88 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  24.57 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.07 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.02 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  25.99 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  33.16 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  28.82 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.08 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.23 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  25.86 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.86 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  25.06 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.22 
 
 		 424 aa  77  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  27.33 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  28.94 
 
 		 404 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  28.02 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  31.76 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  27.64 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.15 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.15 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  36.43 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.1 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  26.09 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  25.54 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  27.48 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.15 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.68 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.37 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  27.12 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  26.7 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  29.14 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  35.66 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>