146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1874 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  100 
 
 
377 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  61.29 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  61.29 
 
 
383 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  60.75 
 
 
383 aa  448  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  60.75 
 
 
383 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  60.48 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  60.48 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  60.48 
 
 
383 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  60.75 
 
 
409 aa  428  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  40.12 
 
 
374 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  35.01 
 
 
360 aa  200  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  36.89 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  31.15 
 
 
368 aa  182  9.000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  30.62 
 
 
377 aa  180  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  35.96 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  31.91 
 
 
392 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  29.7 
 
 
398 aa  158  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  29.9 
 
 
395 aa  153  5e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  30.67 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  30.67 
 
 
376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  29.45 
 
 
376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  30.74 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  30.38 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  30.13 
 
 
377 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  30.87 
 
 
378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  29.25 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  29.64 
 
 
382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  29.25 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  28.19 
 
 
369 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  27.27 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  26.97 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  28.3 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  28.06 
 
 
377 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  26.01 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  26.01 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  26.01 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  26.83 
 
 
372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  25.74 
 
 
372 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  25.74 
 
 
372 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  25.74 
 
 
372 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  29.45 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  26.3 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  27.01 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  26.47 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  27.06 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  26.47 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  25.74 
 
 
372 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  26.3 
 
 
370 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  27.53 
 
 
383 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  27.53 
 
 
377 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  27.22 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  27.22 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  27.22 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  27.22 
 
 
377 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  33.85 
 
 
367 aa  96.7  6e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  30.46 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.37 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  22.55 
 
 
440 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  28.05 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.2 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  26 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  23.14 
 
 
424 aa  67  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  24.05 
 
 
423 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  29.37 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  26.06 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  26.96 
 
 
408 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  23.87 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  23.62 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  23.02 
 
 
441 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.77 
 
 
424 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  22.8 
 
 
441 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  22.83 
 
 
414 aa  63.5  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.32 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  24.86 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  21.96 
 
 
421 aa  62.8  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  23.56 
 
 
427 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  20.11 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  22.9 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.86 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  26.33 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  24.22 
 
 
441 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  24.22 
 
 
441 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  24.25 
 
 
431 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  24.86 
 
 
424 aa  59.7  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  24.75 
 
 
425 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  21.64 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.76 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  25.21 
 
 
384 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  23.7 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  23.71 
 
 
405 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  20 
 
 
437 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  19.51 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.83 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  20.64 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  19.89 
 
 
437 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  19.89 
 
 
437 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  23.71 
 
 
421 aa  56.2  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  22.49 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  22.49 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.37 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>