155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1105 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  100 
 
 
369 aa  720    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  51.68 
 
 
408 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  51.13 
 
 
385 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  51.13 
 
 
385 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  44.8 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  44.8 
 
 
370 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  44.8 
 
 
370 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  45.09 
 
 
370 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  47.2 
 
 
366 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  46.39 
 
 
372 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  45.97 
 
 
372 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  45.97 
 
 
372 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  45.97 
 
 
372 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  45.97 
 
 
372 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  45.97 
 
 
372 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  45.97 
 
 
372 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  45.95 
 
 
372 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  45.97 
 
 
372 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  44.38 
 
 
370 aa  259  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  42.74 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  42.6 
 
 
382 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  44.13 
 
 
376 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  44.41 
 
 
376 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  42.5 
 
 
377 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  45.62 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  45.59 
 
 
377 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  42.94 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  43.55 
 
 
376 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  43.55 
 
 
376 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  45.9 
 
 
383 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  45.9 
 
 
377 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  45.59 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  45.59 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  45.59 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  45.59 
 
 
377 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  43.43 
 
 
378 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  37.46 
 
 
367 aa  169  8e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  28.19 
 
 
383 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  28.19 
 
 
383 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  27.98 
 
 
383 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  27.6 
 
 
383 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  26.96 
 
 
383 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  26.96 
 
 
383 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  26.67 
 
 
383 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.75 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  27.98 
 
 
409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  27.39 
 
 
377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  29.65 
 
 
374 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  31.29 
 
 
370 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  27.3 
 
 
395 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  27.3 
 
 
377 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  25.46 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  26.89 
 
 
366 aa  97.1  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.06 
 
 
405 aa  97.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  25.33 
 
 
368 aa  88.6  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  25.86 
 
 
400 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  27.12 
 
 
417 aa  80.5  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  26.89 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  26.1 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  26.4 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  24.92 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25.57 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  25 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  25.31 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.23 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  26.44 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  24.64 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  26.58 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  25.21 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  25.13 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25.14 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  25.07 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  25.74 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  23.33 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  23.06 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  27.3 
 
 
418 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  24.33 
 
 
401 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  26.13 
 
 
410 aa  66.2  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  26.63 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.2 
 
 
425 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  24.55 
 
 
414 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  26.64 
 
 
429 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  24.46 
 
 
414 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  25.7 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  28.38 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  26.02 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  25.89 
 
 
396 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  26.75 
 
 
396 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  23.94 
 
 
425 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  25.89 
 
 
413 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  26.81 
 
 
429 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  24.23 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  23.08 
 
 
429 aa  60.1  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.23 
 
 
421 aa  59.7  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.5 
 
 
408 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  22.58 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  26.14 
 
 
408 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  20.57 
 
 
419 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  21.83 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  23.78 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>