200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1354 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  100 
 
 		 367 aa  709    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  37.43 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  37.71 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  38.44 
 
 		 377 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  38.69 
 
 		 376 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  40.12 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  40.12 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  39.5 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  39.06 
 
 		 376 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  39.33 
 
 		 377 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  37.18 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  41.44 
 
 		 377 aa  226  7e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  38.11 
 
 		 372 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  36.89 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  36.89 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  37.16 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  38.11 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  37.16 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  36.89 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  37.16 
 
 		 372 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  36.54 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  36.54 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  39.34 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  39.34 
 
 		 376 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  39.22 
 
 		 377 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  36.21 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  36.21 
 
 		 370 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  41.44 
 
 		 383 aa  222  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  41.44 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  36.61 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  41.14 
 
 		 383 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  41.14 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  41.14 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  41.14 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  36.87 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  40.06 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  37.65 
 
 		 370 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  32.16 
 
 		 383 aa  166  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  33.24 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  31.89 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  31.89 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  31.79 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  31.89 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  31.79 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  32.16 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  29.97 
 
 		 360 aa  149  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  32.36 
 
 		 370 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  32.42 
 
 		 374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  32.13 
 
 		 366 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  28.64 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  28.57 
 
 		 377 aa  130  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  28.73 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  33.05 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  29.19 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  29.26 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  28.68 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  24.25 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  24.61 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.73 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  26.29 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.34 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  25 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  22.95 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  27.04 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  27.11 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  24.48 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  25.87 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.53 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0714  hypothetical protein  26.65 
 
 		 410 aa  76.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.318283  normal  0.343566 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  23.46 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.08 
 
 		 425 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  24.18 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  26.84 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  23.59 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.19 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  27.79 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  24.39 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  24.26 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.49 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.39 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  23.82 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  25.43 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  25.92 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  24.77 
 
 		 405 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.8 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  25.22 
 
 		 414 aa  69.3  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  21.74 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  26.33 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  23.48 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  26.53 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  27 
 
 		 604 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.42 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  27.44 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  21.58 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  23.9 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  25.89 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  23.08 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  24.4 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  20.72 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>