124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13780 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  100 
 
 		 360 aa  716    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  40.17 
 
 		 370 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  41.64 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  36.45 
 
 		 383 aa  218  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  36.45 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  36.45 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  36.45 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  36.14 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  36.14 
 
 		 383 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  36.14 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  36.45 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  36.51 
 
 		 395 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  35.67 
 
 		 398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  36.18 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  35.01 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  32.85 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  34.42 
 
 		 382 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  31.86 
 
 		 370 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  30.06 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  30.06 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  30.9 
 
 		 408 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  32.27 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  32.27 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  32.27 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  32.27 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  32.27 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  32.27 
 
 		 372 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  34.73 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  31.09 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  32.27 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  31.09 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  31.09 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  34.41 
 
 		 378 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  31.4 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  31.09 
 
 		 370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  31.95 
 
 		 372 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  35.99 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  32.83 
 
 		 378 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  33.01 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  33.11 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  34.19 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  29.75 
 
 		 369 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  33.11 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  33.23 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  33.11 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  30.31 
 
 		 366 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  33.11 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  33.11 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  33.11 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  33.11 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  32.48 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  29 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  32.48 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  29 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  29.67 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  28.09 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  27.25 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.88 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  23.76 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  25.76 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.69 
 
 		 431 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  22.99 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.84 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  23.59 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  26.05 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  25.32 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  34.48 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.14 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  27.37 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  24.63 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  24.78 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  24.54 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0476  arsenical pump membrane protein  24.16 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  21.26 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  24.39 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  24.1 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  26.03 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.64 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  25.66 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.06 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  23.62 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  23.62 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  28.95 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  24.41 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  21.11 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  23.32 
 
 		 437 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  21.67 
 
 		 425 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  27.11 
 
 		 417 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  23.53 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  24.78 
 
 		 427 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  26.72 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  23.98 
 
 		 402 aa  51.2  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  25.43 
 
 		 419 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  22.69 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  23.6 
 
 		 401 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  24.13 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25 
 
 		 422 aa  49.7  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  24.45 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  24.84 
 
 		 436 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  25.31 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>