76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0898 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  100 
 
 		 395 aa  794    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  66.75 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  41.18 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  36.51 
 
 		 360 aa  210  4e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  33.96 
 
 		 377 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  31.25 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  31.09 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  32.22 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  32.22 
 
 		 383 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  30.73 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  30.41 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  30.41 
 
 		 383 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  31.96 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  30.53 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  27.13 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  30.3 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  28.14 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  28.81 
 
 		 377 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  29.75 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  29.75 
 
 		 385 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  27.65 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  28.53 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  27.93 
 
 		 378 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  27.37 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  30 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  30 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  30 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  30 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  30 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  30 
 
 		 372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  27.65 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  27.65 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  30.29 
 
 		 372 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  30 
 
 		 372 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  29.05 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  29.71 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  28.29 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  29.17 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  29.17 
 
 		 370 aa  109  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  29.17 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  28.87 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  30 
 
 		 370 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  28.87 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  27.61 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  28.57 
 
 		 378 aa  102  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  26.61 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  27.17 
 
 		 377 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  27.17 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  27.17 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  28.53 
 
 		 382 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  27.17 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  27.17 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  27.17 
 
 		 383 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  27.17 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  32.66 
 
 		 367 aa  93.2  8e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.02 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  25 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  25.47 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  24.63 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  23.33 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  23.74 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  21.75 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  24.62 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  23.75 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  27.22 
 
 		 408 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  23.59 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  21.15 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  23.87 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  25.25 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.18 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  24.1 
 
 		 425 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  23.21 
 
 		 431 aa  46.6  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  23.18 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  26.89 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  23.55 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  25 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>