126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0236 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  100 
 
 		 377 aa  730    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  40 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  35.36 
 
 		 370 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  33.77 
 
 		 395 aa  189  5.999999999999999e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  30.08 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  30.08 
 
 		 383 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  29.21 
 
 		 383 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  29.74 
 
 		 409 aa  178  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  29.24 
 
 		 383 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  30.79 
 
 		 398 aa  177  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  30.34 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  28.95 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  28.95 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  32.59 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  29.78 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  29.26 
 
 		 366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  27.74 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  34.03 
 
 		 377 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  34.44 
 
 		 370 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  33.84 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  33.84 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  33.84 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  34.13 
 
 		 377 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  33.94 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  34.26 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  33.96 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  33.96 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  35.28 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  30.7 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  35.33 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  34.4 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  30.37 
 
 		 372 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  35.33 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  35.33 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  29.75 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  29.75 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  31.61 
 
 		 408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  29.75 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  35.02 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  26.91 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  35.02 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  35.02 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  35.02 
 
 		 377 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  29.75 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  29.75 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  29.75 
 
 		 372 aa  114  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  29.79 
 
 		 378 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  30.06 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  31.99 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  29.45 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  31.93 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  31.93 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  30.11 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  27.38 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  27.99 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.58 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.23 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.65 
 
 		 414 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.28 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  27.15 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.76 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3034  arsenite permease  26.01 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.56 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  27.51 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  26.91 
 
 		 402 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4445  Arsenical pump membrane protein  28.27 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.162879 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  25.15 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  27.73 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  24.58 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  25.79 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  22.16 
 
 		 429 aa  56.2  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  24.92 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.44 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  29.54 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  26.42 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  22.54 
 
 		 451 aa  54.3  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  26.82 
 
 		 423 aa  53.9  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  23.3 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  25.87 
 
 		 447 aa  53.1  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1911  citrate transporter  27.57 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0488105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_780  anion permease, ArsB-like protein  26.59 
 
 		 424 aa  52.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  27.79 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.29 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  20.42 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  28.4 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1181  citrate transporter  27.97 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.355056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  25.73 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  23.95 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4221  arsenical pump membrane protein  25.97 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2045  Arsenical pump membrane protein  27.96 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  24.35 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  26.09 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  24.35 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  27.09 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  22.39 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  22.12 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  27.24 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  22.82 
 
 		 447 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  22.39 
 
 		 444 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  23.77 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.771625 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>