181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3316 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  100 
 
 
377 aa  715    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  93.37 
 
 
377 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  93.37 
 
 
377 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  93.37 
 
 
377 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  93.63 
 
 
377 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  93.37 
 
 
377 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  93.1 
 
 
383 aa  596  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  93.37 
 
 
383 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  72.68 
 
 
376 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  72.28 
 
 
378 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  72.01 
 
 
376 aa  480  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  70.59 
 
 
377 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  72.55 
 
 
376 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  72.55 
 
 
376 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  70.86 
 
 
377 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  67.67 
 
 
382 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  47.01 
 
 
408 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  47.95 
 
 
385 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  47.95 
 
 
385 aa  269  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  43.28 
 
 
370 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  42.74 
 
 
369 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  41.69 
 
 
366 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  39.28 
 
 
370 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  39 
 
 
370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  39 
 
 
370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  39 
 
 
370 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  40.8 
 
 
372 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  39.03 
 
 
372 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  40.67 
 
 
372 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  40.37 
 
 
372 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  40.37 
 
 
372 aa  229  8e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  40.37 
 
 
372 aa  229  8e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  40.67 
 
 
372 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  47.09 
 
 
378 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  40.43 
 
 
367 aa  177  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  28.96 
 
 
383 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  28.96 
 
 
383 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  31.69 
 
 
370 aa  140  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  28.69 
 
 
383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  28.42 
 
 
383 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  28.42 
 
 
383 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  28.81 
 
 
383 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  28.81 
 
 
383 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  33.55 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  31.51 
 
 
374 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  28 
 
 
409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  35.02 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  31.42 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  29.58 
 
 
377 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  31.85 
 
 
405 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  29.02 
 
 
366 aa  103  7e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  31.23 
 
 
402 aa  102  9e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  26.33 
 
 
398 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  25.49 
 
 
395 aa  102  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  27.99 
 
 
392 aa  100  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  32.31 
 
 
413 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.33 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  32.31 
 
 
429 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  26.55 
 
 
368 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  31.86 
 
 
429 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  30.37 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  32.07 
 
 
418 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  27.66 
 
 
401 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  26.96 
 
 
411 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.43 
 
 
426 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.27 
 
 
400 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  25.51 
 
 
440 aa  86.7  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.62 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.22 
 
 
419 aa  85.5  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  31.1 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  29.51 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  26.33 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  38.64 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.15 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.45 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.57 
 
 
422 aa  77  0.0000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  27.64 
 
 
405 aa  77  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25.83 
 
 
421 aa  77  0.0000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  29.38 
 
 
414 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  29.36 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  26.74 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  27.76 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.82 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  22.46 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  26.61 
 
 
414 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  22.85 
 
 
577 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2453  membrane anion transport protein  32.21 
 
 
413 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24 
 
 
421 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  23.47 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  25.96 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  23.8 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  22.28 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  25.29 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  24.64 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.71 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  25.2 
 
 
423 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  33.77 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  24.34 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>