230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3360 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  100 
 
 		 370 aa  720    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  60.06 
 
 		 370 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  60.34 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  60.34 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  60.34 
 
 		 370 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  58.29 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  58.63 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  58.36 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  58.36 
 
 		 372 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  48.57 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  48.31 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  48.31 
 
 		 385 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  43.14 
 
 		 377 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  42.13 
 
 		 382 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  44.26 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  43.82 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  43.7 
 
 		 377 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  43.21 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  44.38 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  43.28 
 
 		 377 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  43.26 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  43.26 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  42.47 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  42.47 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  42.47 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  42.2 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  42.2 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  42.2 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  42.2 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  44.16 
 
 		 378 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  39.17 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  32.39 
 
 		 360 aa  136  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  28.45 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  28.45 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  28.45 
 
 		 383 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  28.45 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  28.53 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  28.73 
 
 		 383 aa  122  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  28.73 
 
 		 383 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  28.45 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  30.97 
 
 		 377 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  31.5 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  29.49 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  28.69 
 
 		 398 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  30.57 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.7 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.85 
 
 		 419 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  30.05 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  30.58 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  28.07 
 
 		 425 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  28.46 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  28.37 
 
 		 425 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  24.79 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  28.88 
 
 		 426 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  27.06 
 
 		 377 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  25.75 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  30.03 
 
 		 422 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.15 
 
 		 404 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  27.05 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  29.13 
 
 		 401 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  28.74 
 
 		 396 aa  86.3  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  27.43 
 
 		 413 aa  85.9  9e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  28.04 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  26.93 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.27 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  28.33 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  27.74 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  29.6 
 
 		 396 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  31.22 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  30.94 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  26.96 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  24.94 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.61 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.05 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  30.33 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  25.49 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  29.28 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.59 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  25.29 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  26.98 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  30.17 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  26.18 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.86 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  26.75 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  26.75 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  25.69 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  25.67 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  26.06 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  24.2 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  26.61 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  27.37 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  26.14 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  27.34 
 
 		 429 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.2 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>