More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1545 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1545  citrate transporter  100 
 
 
429 aa  826    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000185011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1546  citrate transporter  61.31 
 
 
429 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0084311  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  48.02 
 
 
408 aa  352  5e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  44.55 
 
 
425 aa  349  7e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  44.47 
 
 
425 aa  338  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  38.33 
 
 
423 aa  292  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1576  citrate transporter  39.63 
 
 
422 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000162894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  37.14 
 
 
421 aa  279  7e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  37 
 
 
419 aa  273  6e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  38.04 
 
 
422 aa  271  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  39.85 
 
 
424 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3119  Citrate transporter  39.15 
 
 
431 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0395864  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  36.34 
 
 
424 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  38.29 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  37.68 
 
 
427 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3120  Citrate transporter  37.59 
 
 
427 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.019931  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  35.95 
 
 
427 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  35.71 
 
 
426 aa  247  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2091  arsenic transporter family protein  38.14 
 
 
423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000299539  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12699  arsenic-transport integral membrane protein arsA  34.26 
 
 
429 aa  245  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  33.8 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  34.71 
 
 
440 aa  244  3e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12700  arsenic-transport integral membrane protein arsB1  34.1 
 
 
428 aa  242  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1243  Citrate transporter  36.63 
 
 
415 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000320263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0719  Citrate transporter  33.85 
 
 
451 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05280  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  35.65 
 
 
427 aa  239  8e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00452753  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0587  citrate transporter  32 
 
 
437 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0599  citrate transporter  32 
 
 
437 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404538  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0577  citrate transporter  32 
 
 
437 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1846  citrate transporter  36.75 
 
 
424 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3393  citrate transporter  32.48 
 
 
428 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  35.99 
 
 
440 aa  229  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0191  arsenical pump family protein  34.36 
 
 
441 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5055  arsenical pump family protein  34.12 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3522  citrate transporter  34.2 
 
 
441 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1020  citrate transporter  36.66 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  36.36 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5043  arsenical pump family protein  33.96 
 
 
441 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3015  Citrate transporter  33.25 
 
 
440 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4733  citrate transporter  34.2 
 
 
444 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3181  citrate transporter  31.04 
 
 
441 aa  218  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3185  arsenical pump family protein  31.28 
 
 
441 aa  217  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0297754  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3482  arsenical pump family protein  30.57 
 
 
441 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4163  Citrate transporter  34.12 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0610  Citrate transporter  36.18 
 
 
429 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5050  arsenical pump family protein  33.96 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3498  arsenical pump family protein  31.52 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.97762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1780  arsenical pump family protein  31.28 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5022  arsenical pump family protein  33.73 
 
 
441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3469  arsenical pump family protein  31.04 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.236736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4621  arsenical pump membrane protein  33.73 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4643  arsenical pump membrane protein  33.73 
 
 
444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4781  arsenical pump family protein  33.73 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5143  arsenical pump family protein  33.73 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3486  arsenical pump family protein  30.81 
 
 
441 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3270  arsenical pump family protein  30.81 
 
 
441 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0316539  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3243  arsenical pump family protein  30.81 
 
 
441 aa  210  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000351767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3526  arsenical pump family protein  30.81 
 
 
441 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0523462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2196  citrate transporter  30.57 
 
 
451 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.339032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0796  citrate transporter  33.5 
 
 
424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1338  citrate transporter  32.28 
 
 
577 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  32.73 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44788  predicted protein  30.34 
 
 
967 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  33.33 
 
 
421 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1763  citrate transporter  31.07 
 
 
421 aa  169  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  28.87 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0353  citrate transporter  30.26 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0143046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4948  Citrate transporter  26.86 
 
 
445 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.837621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1203  citrate transporter  26.88 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3289  Citrate transporter  27.85 
 
 
444 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0922989  normal  0.519081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2811  Citrate transporter  27.85 
 
 
444 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  29.14 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1592  citrate transporter  27.85 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0878  arsenical pump membrane protein  26.58 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.201371  hitchhiker  0.000139145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5261  Citrate transporter  24.88 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10417  normal  0.132031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2052  citrate transporter  25.39 
 
 
447 aa  126  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  26.32 
 
 
405 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  28.57 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  26.38 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0041  transport protein  25.89 
 
 
434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2086  citrate transporter  29.01 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.771625 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5880  citrate transporter  23.67 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  27 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  28.13 
 
 
404 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.57 
 
 
408 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2430  arsenical pump membrane protein  24.89 
 
 
429 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  27.38 
 
 
402 aa  106  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  25.63 
 
 
411 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  23.98 
 
 
414 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  27.38 
 
 
436 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0209  arsenical pump membrane protein, putative  25.36 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.144741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1533  citrate transporter  24.87 
 
 
452 aa  99.4  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.232848  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  26.98 
 
 
421 aa  99  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0932  Arsenical pump membrane protein  25.44 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0210  arsenical pump membrane protein  23.25 
 
 
430 aa  96.7  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1528  Arsenical pump membrane protein  24.49 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0428092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  25.58 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  23.51 
 
 
404 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2462  arsenical pump membrane protein  23.43 
 
 
427 aa  93.2  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.406949  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  26.89 
 
 
397 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>