186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0114 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  94.15 
 
 		 376 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  98.4 
 
 		 376 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  100 
 
 		 376 aa  717    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  98.4 
 
 		 376 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  89.6 
 
 		 378 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  87.5 
 
 		 377 aa  610  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  87.5 
 
 		 377 aa  596  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  72.01 
 
 		 377 aa  474  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  71.47 
 
 		 377 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  71.47 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  71.2 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  71.2 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  71.47 
 
 		 377 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  71.2 
 
 		 377 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  71.2 
 
 		 383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  65.93 
 
 		 382 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  52.41 
 
 		 408 aa  292  5e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  51.22 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  51.22 
 
 		 385 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  43.82 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  45.32 
 
 		 369 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  49.85 
 
 		 378 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  42.15 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  42.55 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  42.51 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  42.51 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  42.51 
 
 		 370 aa  223  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  43.03 
 
 		 372 aa  223  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  42.81 
 
 		 372 aa  222  7e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  42.51 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  42.51 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  42.81 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  42.81 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  42.81 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  42.51 
 
 		 372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  42.81 
 
 		 372 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  41.07 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  29.29 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  29.29 
 
 		 383 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  29.33 
 
 		 383 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  28.99 
 
 		 383 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  29.33 
 
 		 383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  29.24 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  29.24 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  28.7 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  28.74 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  33.76 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  29.43 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  34.57 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  30.99 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  26.91 
 
 		 398 aa  116  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  27.65 
 
 		 395 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  28.61 
 
 		 419 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  29.71 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  25.76 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  30.73 
 
 		 405 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  29.32 
 
 		 426 aa  97.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  27.51 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  30.28 
 
 		 405 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  30.11 
 
 		 413 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  28.88 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  29.34 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  28.62 
 
 		 404 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  24.51 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  29.71 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  28.53 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  25.44 
 
 		 392 aa  84.3  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  29.58 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  23.01 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.77 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  31.93 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  25.84 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  30.29 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  28.93 
 
 		 421 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  30.18 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  22.28 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  31.03 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  27.98 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.27 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  26.39 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.86 
 
 		 431 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  30.41 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  23.8 
 
 		 421 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1699  citrate transporter  25.61 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.346911  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  29.88 
 
 		 396 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  32.67 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  27.01 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  29.37 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0644  Citrate transporter  26.45 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  22.76 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  24.78 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  28.74 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  22.54 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2789  arsenite efflux membrane component-like protein  24.49 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0292  citrate transporter  24.58 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.77 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2935  arsenite efflux membrane component-like protein  24.49 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1347  citrate transporter  24.7 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  20.06 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2166  arsenic transporter family protein  24.13 
 
 		 423 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>