198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0097 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0097  citrate transporter  100 
 
 
378 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3279  NhaD family Na(+)/H(+) antiporter  90.13 
 
 
376 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362717  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0114  citrate transporter  89.6 
 
 
376 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2958  citrate transporter  89.07 
 
 
376 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.586006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0097  citrate transporter  89.07 
 
 
376 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0088  citrate transporter  86.13 
 
 
377 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0648559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0098  citrate transporter  86.4 
 
 
377 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0442697  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3316  transporter, putative  72.09 
 
 
377 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.468261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3977  transporter, putative  71.27 
 
 
377 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.108981  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0186  transporter, putative  71.27 
 
 
383 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0404913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4051  transporter, putative  71.27 
 
 
377 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2948  transporter, putative  71 
 
 
383 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3363  putative transporter  71 
 
 
377 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431156  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1595  putative transporter  71 
 
 
377 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.169606  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3007  putative transporter  71 
 
 
377 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.687698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3035  citrate transporter  64.36 
 
 
382 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01905  hypothetical protein  51.64 
 
 
408 aa  288  8e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.224952 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4486  Citrate transporter  49.7 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.333604  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4619  Citrate transporter  49.7 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  0.610654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3360  citrate transporter  44.77 
 
 
370 aa  254  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1105  transmembrane protein  45.62 
 
 
369 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1305  citrate transporter  40.53 
 
 
366 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0842  citrate transporter family protein  42.41 
 
 
372 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0967  citrate transporter family protein  42.2 
 
 
372 aa  220  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276496  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2825  citrate transporter  42.2 
 
 
372 aa  219  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0888  citrate transporter family protein  42.2 
 
 
372 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0807768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0875  citrate transporter family protein  42.2 
 
 
372 aa  219  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00785  predicted transporter  41.9 
 
 
372 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2824  Citrate transporter  41.9 
 
 
372 aa  219  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00802  hypothetical protein  41.9 
 
 
372 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2530  citrate transporter family protein  42.2 
 
 
372 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0904  citrate transporter family protein  39.94 
 
 
370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4885  Citrate transporter  45.37 
 
 
378 aa  213  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0876  citrate transporter family protein  40.06 
 
 
370 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0967  citrate transporter family protein  40.06 
 
 
370 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0934  citrate transporter family protein  40.06 
 
 
370 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1354  Citrate transporter  41.46 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0783517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2935  transporter  30.41 
 
 
383 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.070844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3157  transporter  30.41 
 
 
383 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2095  putative transporter  30.92 
 
 
383 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3145  putative transporter  30.32 
 
 
383 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2909  transporter  30.12 
 
 
383 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.204967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3166  putative transporter  30.12 
 
 
383 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3173  putative transporter  30.12 
 
 
383 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.745852  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3520  Citrate transporter  30.93 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000961964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2859  transporter  30.61 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.265572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13780  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  34.73 
 
 
360 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3129  citrate transporter  30.38 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.246897  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0236  Citrate transporter  35.06 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1874  citrate transporter  31.51 
 
 
377 aa  120  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.870467  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1042  citrate transporter  27.6 
 
 
398 aa  119  9e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0898  putative di-/tri-carboxylate transporter  27.93 
 
 
395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.878085  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0595  di- and tricarboxylate transporter  29.03 
 
 
366 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0077  di- and tricarboxylate transporter  26.97 
 
 
368 aa  110  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000154883  normal  0.998926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0517  Citrate transporter  29.12 
 
 
419 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3623  citrate transporter  29.78 
 
 
408 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.893629  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3351  citrate transporter  30.43 
 
 
426 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0890  citrate transporter  30.17 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3609  arsenical pump membrane protein  27.54 
 
 
400 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0791  transporter, putative  32.51 
 
 
413 aa  87.8  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0000900832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3167  Citrate transporter  26.97 
 
 
401 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1014  citrate transporter  29.75 
 
 
417 aa  87.4  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.460106  normal  0.615622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1155  Citrate transporter  29.79 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  hitchhiker  0.00000561595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0736  Citrate transporter  29.91 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000586642  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1949  di- or tricarboxylate transporter  25.85 
 
 
392 aa  85.1  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00031029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2179  Citrate transporter  32.52 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.365057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0152  Citrate transporter  24.93 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0904912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0573  arsenite permease  29.12 
 
 
422 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.77742  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0803  citrate transporter  28.82 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.324785  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3536  citrate transporter  29.62 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.164085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2132  citrate transporter  25.68 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1677  arsenical pump membrane protein  32.11 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1022  citrate transporter  24.27 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.681723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2268  Citrate transporter  31.17 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153576  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0377  putative membrane anion transport protein  29.66 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1426  citrate transporter  30.75 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0950  citrate transporter  29.07 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0015  citrate transporter  26.82 
 
 
431 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1987  citrate transporter  23.8 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0408883  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0585  Citrate transporter  30.89 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176534 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3003  Citrate transporter  24.6 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.467827 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0101  Citrate transporter  30.5 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.243285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2433  Citrate transporter  23.72 
 
 
440 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0484148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1808  citrate transporter  25.41 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2127  citrate transporter  29.87 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0956182  normal  0.0626222 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1124  Citrate transporter  26.16 
 
 
411 aa  73.6  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0305  citrate transporter  27.48 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.368215  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1471  citrate transporter  22.87 
 
 
424 aa  72.8  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26370  Na+/H+ antiporter NhaD-like permease  23.51 
 
 
422 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1423  citrate transporter  25.28 
 
 
404 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.418451  normal  0.0399282 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1706  citrate transporter  27.93 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1846  citrate transporter  25.58 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2622  Citrate transporter  27.6 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0352  citrate transporter  22.41 
 
 
408 aa  70.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000181874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1466  citrate transporter  20.77 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.406025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1990  citrate transporter  23.86 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000159271  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0827  citrate transporter  23.58 
 
 
440 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3669  Citrate transporter  25.07 
 
 
431 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.955706  normal  0.0571681 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13038  ArsB family transporter: P-protein-like protein (tyrosine transporter)  26.05 
 
 
447 aa  68.2  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0400673  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3589  citrate transporter  30.21 
 
 
404 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453935  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>